结论：关于“由乙方自行承担责任是否包括相关费用”的问题，这主要取决于双方合同中的具体约定以及相关法律法规的规定。在多数情况下，如果合同中明确约定了乙方自行承担责任包括相关费用，那么乙方就需要承担这些费用；如果合同中没有明确约定或者约定不明确，则需要根据具体情况和相关法律法规来判断。
分析说明：
合同约定优先：
- 在合同纠纷中，合同是双方权利义务的基础。如果合同中明确规定了“由乙方自行承担责任，包括相关费用”，那么这一条款就是双方必须遵守的。在这种情况下，乙方需要承担因违约、侵权或其他责任而产生的所有相关费用，如诉讼费、律师费、赔偿金等。
合同未约定或约定不明确：
- 如果合同中没有明确约定乙方自行承担责任是否包括相关费用，或者约定不明确，那么就需要根据相关法律法规和交易习惯来判断。
- 在这种情况下，如果乙方因违约或侵权行为给甲方造成了损失，甲方有权要求乙方赔偿损失，包括直接损失和间接损失。而相关费用（如诉讼费、律师费等）是否属于赔偿范围，则可能需要根据具体案件情况和法院的判决来确定。
相关法律法规的适用：
- 除了合同约定外，相关法律法规也可能对责任承担和费用问题有规定。例如，在某些特定类型的合同纠纷中，法律可能明确规定了责任承担方式和费用分担原则。
- 因此，在处理合同纠纷时，除了审查合同条款外，还需要仔细研究相关法律法规，以确保处理结果的合法性和公正性。
法律建议：
- 明确合同条款：为了避免纠纷和误解，建议在合同中明确约定责任承担方式和费用分担原则。这样可以在发生纠纷时，有明确的依据可以遵循。
- 咨询专业律师：在处理合同纠纷时，如果涉及复杂的法律问题或金额较大的争议，建议咨询专业律师的意见。律师可以根据具体情况提供专业的法律建议和解决方案。
- 保留相关证据：在合同履行过程中，双方都应保留好相关证据，如合同文本、付款凭证、通信记录等。这些证据在发生纠纷时可能起到关键作用。
可能后果：
- 如果乙方未按照合同约定承担相关费用，甲方有权要求乙方履行合同义务或承担违约责任。这可能导致乙方需要支付额外的费用或面临法律诉讼等后果。
- 如果双方因费用问题无法达成一致，可能需要通过诉讼或仲裁等方式解决纠纷。这将耗费双方的时间和精力，并可能产生额外的费用。
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