行政侵权赔偿案件确实包括行政机关侵犯发明专利权的情况。以下从多个角度对此进行详细分析：
一、法律依据
根据《中华人民共和国专利法》第六十五条的规定，未经专利权人许可，实施其专利，即侵犯其专利权，引起纠纷的，专利权人或者利害关系人可以请求管理专利工作的部门处理。管理专利工作的部门在处理时，如果认定侵权行为成立，可以责令侵权人立即停止侵权行为。如果侵权人期满不起诉又不停止侵权行为的，管理专利工作的部门还可以申请人民法院强制执行。这一条款明确规定了行政机关在专利侵权纠纷中的处理权力和责任，也间接说明了行政机关可能因侵犯专利权而成为行政侵权赔偿案件的被告。
二、行政机关侵犯专利权的具体情形
行政机关侵犯专利权可能发生在多种情形下，例如：
行政机关未经许可使用专利技术：如果行政机关在执行公务或进行其他活动时，未经专利权人许可使用了其专利技术，就可能构成对专利权的侵犯。
行政机关支持或纵容他人侵犯专利权：行政机关如果明知他人侵犯专利权而不予制止，或者甚至提供支持或纵容，也可能被视为对专利权的间接侵犯。
三、行政侵权赔偿案件的处理
当行政机关被认定侵犯专利权时，专利权人或利害关系人可以依法提起行政侵权赔偿诉讼。在诉讼过程中，法院将根据事实和法律规定，判断行政机关的行为是否构成侵权，并据此作出赔偿判决。赔偿的范围通常包括因侵权行为所造成的直接经济损失、合理开支以及可能的惩罚性赔偿等。
四、实际案例与启示
虽然具体的行政侵权赔偿案件可能因情况而异，但已有不少案例表明，行政机关确实可能因侵犯专利权而承担赔偿责任。这些案例提醒我们，无论是个人还是行政机关，在涉及专利权的问题上都必须保持谨慎和尊重，避免侵犯他人的合法权益。
五、建议与措施
对于行政机关而言，为了避免侵犯专利权并减少行政侵权赔偿案件的发生，可以采取以下措施：
加强专利法宣传和培训：提高行政机关工作人员对专利法的认识和了解，增强他们的法律意识和风险意识。
建立专利审查机制：在行政机关进行涉及专利技术的活动时，建立严格的专利审查机制，确保所使用的技术不侵犯他人的专利权。
及时咨询专业律师：在涉及专利权的问题上，行政机关应及时咨询专业律师的意见和建议，以确保自己的行为合法合规。
综上所述，行政侵权赔偿案件确实包括行政机关侵犯发明专利权的情况。在处理此类案件时，我们应依据相关法律法规和事实情况进行判断和处理，并采取有效措施预防类似案件的发生。如果你有进一步的法律问题或需要更详细的法律建议，可以直接向我咨询。