在医疗纠纷案件中，举证期限内未提交证据，并不直接等同于程序违法，但可能会面临证据不被采纳等不利后果。以下从不同角度为你详细分析：
举证期限的法律意义
- 举证期限是诉讼程序中一个重要的时间节点，它要求当事人在规定的时间内提交证据，以确保诉讼的效率和公正性。在医疗纠纷案件中，举证期限同样适用，它要求医患双方在规定的时间内提交与案件相关的证据材料。
未在举证期限内提交证据的法律后果
- 证据失权：根据《最高人民法院关于民事诉讼证据的若干规定》，当事人逾期提供证据的，人民法院应当责令其说明理由；拒不说明理由或者理由不成立的，人民法院根据不同情形可以不予采纳该证据，或者采纳该证据但予以训诫、罚款。这意味着，如果未在举证期限内提交证据，且没有合理的理由，该证据可能不会被法院采纳，从而影响案件的审理结果。
- 影响诉讼进程：未在举证期限内提交证据，还可能导致诉讼进程的延误。因为法院需要时间来审查和处理新提交的证据，这可能会增加诉讼的时间和成本。
特殊情况下的处理
- 新证据的提交：如果当事人在举证期限届满后才发现新的证据，或者因客观原因无法在举证期限内提交证据，可以向法院申请延长举证期限或者提交新证据。法院会根据具体情况决定是否准许。
- 证据的补正：如果当事人在举证期限内提交的证据存在瑕疵或者不足，可以在举证期限届满前进行补正。补正后的证据如果符合法院的要求，仍然会被采纳。
程序违法与证据提交的关系
- 程序违法通常指的是诉讼过程中违反法定程序的行为，如未经许可擅自缺席庭审、违反回避制度等。而未在举证期限内提交证据，并不直接构成程序违法。但是，如果这种行为严重影响了诉讼的公正性和效率，法院可能会根据具体情况作出相应的处理，如训诫、罚款等。
建议：
- 在医疗纠纷案件中，医患双方应严格遵守举证期限的规定，及时提交证据材料。
- 如果因特殊原因无法在举证期限内提交证据，应及时向法院申请延长举证期限或者提交新证据。
- 在提交证据时，应确保证据的完整性和真实性，避免因证据瑕疵而影响案件的审理结果。
如果你在医疗纠纷案件中遇到了举证期限相关的问题，或者对证据的提交和采纳有疑问，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况为你提供专业的法律建议。