在厂里面出示毕业证并不违法，但关键在于出示的方式和目的。

首先，我们要明确的是，任何单位和个人都没有权利扣留他人证件原件，这是由《劳动合同法》明确规定的。毕业证作为个人重要的学历证明文件，其原件应当由个人妥善保管，不应轻易交予他人，更不应被用人单位扣留。

在入职过程中，如果用人单位需要验证求职者的学历信息，求职者仅需向有关人员出示毕业证原件以供查验，而无需将原件交予用人单位保管。如果用人单位要求提供毕业证的复印件或影印件，求职者可以在合适位置注明具体用途，如“仅供XX公司入职查验使用”，以防止复印件被滥用。

此外，我还要提醒您，除了扣押证件外，还有一些公司可能会以各种名义收取费用，如报名费、服装费、体检费、培训费等。这些费用在求职过程中通常是不需要的，求职者应当谨慎对待，避免上当受骗。

最后，如果您在入职过程中遇到任何侵权情况，如扣押证件、收取不合理费用等，您可以立即拨打12333电话或前往人社部门投诉举报，以维护自己的合法权益。如果人身安全受到威胁或伤害，请立即向公安部门报警。

总之，出示毕业证并不违法，但求职者应当保持警惕，确保自己的证件原件不被扣留，同时避免支付任何不合理的费用。