村委会主任在废弃房屋承包合同上签字是否有效，需分情况讨论，具体如下：

1. 若村委会主任有合法授权或职务行为属性
   根据《村民委员会组织法》第二十四条，涉及村集体资产处置（如废弃房屋承包）需经村民会议或村民代表会议讨论决定。若合同内容已履行法定民主议定程序，且村委会主任作为法定代表人签字，则合同有效。
   关键点：需留存会议记录、表决结果等证明程序合法性的材料，否则可能因程序瑕疵导致合同效力争议。

2. 若村委会主任无授权或超越权限
   若合同未经过民主议定程序，或村委会主任以个人名义签字（非职务行为），则属于无权代理。根据《民法典》第一百七十一条，合同效力处于待定状态：

   • 相对人可催告村委会在30日内追认；
     
   • 若村委会明确拒绝或未追认，合同对村集体不发生效力，由行为人（村委会主任）承担责任。
     例外情形：若相对人有理由相信村委会主任有代理权（如持有加盖公章的空白合同），可能构成表见代理，合同仍有效。

3. 合同形式要件的影响
   根据《民法典》第四百六十九条，书面合同需双方签字或盖章。若合同仅由村委会主任签字而未加盖村委会公章：

   • 若村委会主任是法定代表人（如主任由上级任命且依法登记），签字具有法律效力；
     
   • 若非法定代表人，需结合授权文件判断效力，否则可能因形式瑕疵影响合同成立。

实务建议：

1. 签订合同前，要求村委会出示民主议定程序文件（如会议记录、表决签字表）及授权委托书；
   
2. 合同需加盖村委会公章，并由法定代表人或授权代表签字；
   
3. 若发现程序瑕疵，可要求补充履行民主议定程序或签订补充协议；
   
4. 涉及重大资产处置，建议同步向乡镇政府备案，增强合同公信力。
   

如有具体合同文本或程序细节需要分析，可进一步提供信息，我将结合条款内容为您详细解答。