发现工资少发一千，你可以按照以下步骤处理：

1. 核实工资条与合同
   首先，仔细核对工资条上的各项明细（如基本工资、绩效、补贴等），确认少发的具体项目。同时，检查劳动合同中关于工资结构、发放时间、计算方式的约定，判断公司是否存在违约行为。例如，若合同明确约定每月固定工资包含1000元岗位津贴，但本月未发放，则公司可能涉嫌违约。

2. 与公司沟通协商
   及时与直属领导或人力资源部门沟通，说明工资异常情况。沟通时注意保留证据（如聊天记录、邮件、录音等），要求公司出具书面解释。若公司承认是财务疏漏或系统错误，可要求补发差额并注明补发原因；若公司以“考核不达标”“经营困难”等理由扣减，需进一步核实扣减依据是否合法。

3. 核查公司规章制度
   若公司以内部制度为由扣减工资（如迟到罚款、绩效不达标扣薪等），需确认该制度是否符合法律规定：

   • 制度是否经民主程序制定（如职工代表大会讨论、公示）；
     
   • 扣减金额是否合理（如单次迟到罚款不得超过当月工资的20%）；
     
   • 是否与劳动合同约定冲突。
     若制度违法，公司无权以此扣减工资。

4. 向劳动监察部门投诉
   若公司拒绝补发且无合法理由，可向当地劳动保障监察大队投诉（可通过“全国根治欠薪线索反映平台”提交线索）。投诉时需提供劳动合同、工资条、沟通记录等证据，监察部门会介入调查并责令公司限期支付。

5. 申请劳动仲裁
   若投诉未果，可向劳动合同履行地或公司所在地的劳动争议仲裁委员会申请仲裁，主张公司支付工资差额及可能的赔偿金（如拖欠工资导致解除劳动合同的，可要求经济补偿）。仲裁时效为1年，自知道或应当知道权益受损之日起计算。

注意事项：

• 保留所有与工资相关的证据（合同、工资条、银行流水、沟通记录等）；
  
• 避免因情绪激动采取过激行为（如罢工、破坏公司财物），否则可能承担法律责任；
  
• 若公司存在恶意拖欠工资（如超过1个月未支付），可依据《劳动合同法》第38条解除劳动合同并主张经济补偿。
  

如有进一步疑问，可直接向我咨询具体操作细节。