若公司发现用水计划指标被冒用，首先应明确的是，这涉及对公司合法权益的侵害，公司有权采取法律措施维护自身权益。以下是从不同角度对此问题的详细分析：
一、法律背景与依据
《中华人民共和国民法典》相关规定：
- 根据《民法典》中关于侵权责任的规定，任何组织或者个人不得以干涉、盗用、假冒等方式侵害他人的合法权益。冒用公司用水计划指标，显然侵犯了公司的合法权益，公司有权要求侵权人停止侵害、排除妨碍、消除危险，并有权要求赔偿损失。
《中华人民共和国水法》及相关地方性法规：
- 《水法》及地方性法规对水资源的分配、使用和管理有明确规定。冒用公司用水计划指标，可能违反了水资源管理的相关规定，公司可以向水行政主管部门举报，要求对侵权人进行行政处罚。
二、法律建议与行动步骤
收集证据：
- 公司应首先收集冒用用水计划指标的相关证据，包括但不限于用水记录、缴费凭证、与侵权人的沟通记录等。这些证据将有助于后续的法律行动。
与侵权人协商：
- 在掌握充分证据后，公司可以尝试与侵权人进行协商，要求其停止冒用行为，并赔偿因此给公司造成的损失。协商过程中，应保留好相关证据，以备不时之需。
向水行政主管部门举报：
- 如果协商无果，公司可以向当地的水行政主管部门举报侵权人的行为。水行政主管部门将依法进行调查，并根据调查结果对侵权人进行行政处罚。
提起民事诉讼：
- 如果侵权人的行为给公司造成了重大损失，且协商和举报均未能解决问题，公司可以考虑向人民法院提起民事诉讼，要求侵权人承担民事责任，包括停止侵害、赔偿损失等。
三、可能的法律后果
行政处罚：
- 如果侵权人的行为违反了水资源管理的相关规定，水行政主管部门将依法对其进行行政处罚，包括罚款、没收违法所得等。
民事责任：
- 如果侵权人的行为给公司造成了损失，公司有权要求其承担民事责任。法院将根据侵权行为的性质、情节和后果，判决侵权人承担相应的赔偿责任。
刑事责任（在极端情况下）：
- 如果侵权人的行为构成犯罪（如诈骗、盗窃等），将依法追究其刑事责任。但这种情况相对较少见，需要具体分析侵权行为的性质和情节。
四、预防措施与建议
加强内部管理：
- 公司应加强对用水计划指标的管理，确保指标的分配、使用和记录都符合规定。同时，应定期对用水情况进行审计和检查，及时发现并纠正问题。
提高法律意识：
- 公司应加强对员工的法律培训，提高员工的法律意识和风险防范能力。员工应了解并遵守相关法律法规和公司规章制度，避免因个人行为给公司带来法律风险。
建立应急机制：
- 公司应建立应对用水计划指标被冒用的应急机制，明确应急处理流程和责任分工。一旦发现冒用行为，应迅速启动应急机制，采取有效措施维护公司权益。
综上所述，公司发现用水计划指标被冒用后，应首先收集证据，然后与侵权人协商或向水行政主管部门举报。如果问题无法解决，可以考虑提起民事诉讼。同时，公司应加强内部管理、提高法律意识并建立应急机制，以预防类似问题的再次发生。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。