结论：公司公章由财务部门管理并不必然违法，但需结合公司实际情况及内部管理制度综合判断其合法性与合理性。以下从多个角度进行分析：
一、公章管理主体的法律未明确规定
《中华人民共和国公司法》并未明确规定公司公章的具体管理主体。因此，公司有权根据自身组织结构和内部管理制度来确定公章的管理者。这意味着，无论是法定代表人、行政部门还是财务部门，只要符合公司内部规定，均可成为公章的管理主体。
二、财务部门管理公章的合理性分析
财务事务频繁使用：
- 财务部门在处理公司财务事务时，如银行账户开户、税务申报、资金划转等，经常需要使用公章。因此，将公章交由财务部门管理，可以提高财务工作效率，减少因公章传递而产生的时间成本。
风险把控能力：
- 财务部门对公司财务状况有深入了解，能够更好地把控与财务相关的用印风险。例如，在签署财务合同或文件时，财务部门可以审核合同内容，确保公司财务安全。
内部监督机制：
- 若公司建立了完善的公章使用登记制度和审批流程，财务部门作为公章管理者，可以详细记录用印信息，便于公司内部监督和追溯。这有助于防止公章滥用和不当使用。
三、公章管理不善的法律责任
尽管财务部门管理公章具有合理性，但公司仍需注意公章管理不善可能带来的法律责任。根据《民法典》及相关司法解释，若公司因公章管理不善导致他人滥用，给公司造成损失的，相关责任人员可能需承担赔偿责任。因此，无论公章由哪个部门管理，公司都应确保公章管理和使用符合法律法规要求，避免不必要的法律风险。
四、公司内部自治与公章管理规定
制定具体管理办法：
- 公司应根据自身情况制定具体的公章管理办法，明确公章的管理主体、使用范围、审批流程等。这有助于规范公章的使用，防止滥用和不当使用。
遵循公司章程和内部管理制度：
- 公司应查阅公司章程、内部管理制度或相关文件，确保公章管理符合公司规定。若公司章程或内部管理制度对公章管理有明确规定，则应遵循这些规定进行管理。
加强监督与追溯机制：
- 公司应建立完善的公章使用监督和追溯机制，确保公章使用的合法性和安全性。这可以通过建立公章使用登记制度、定期审计公章使用情况等方式实现。
五、建议
明确公章管理者：
- 公司应根据自身情况明确公章的管理者，并确保管理者具备相应的管理能力和风险把控能力。
完善管理制度：
- 公司应制定完善的公章管理制度，明确公章的使用范围、审批流程、监督机制等，确保公章使用的规范性和安全性。
加强培训与教育：
- 公司应定期对公章管理者和使用者进行培训和教育，提高他们的法律意识和风险意识，防止因疏忽或故意而导致的公章滥用和不当使用。
若您对公司公章管理有任何疑问或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。