结论概述：针对您在美容店充值后店铺倒闭、老板跑路且已过三年的情况，您仍有权尝试通过法律途径追讨损失，但需考虑诉讼时效、证据收集及执行难度等多方面因素。以下是对此问题的详细分析：

1. 诉讼时效问题：

   • 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间通常为三年，自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。然而，在特定情况下，如您能证明存在诉讼时效中断或中止的情形（如曾向老板主张权利、老板承诺还款等），诉讼时效可能会重新计算或延长。
   • 分析：虽然已过三年，但如果您能提供证据证明在此期间曾尝试追讨或老板有还款承诺等，可能仍有机会通过法律途径追讨。若无法提供此类证据，则可能面临诉讼时效已过的风险。

2. 证据收集问题：

   • 在追讨损失的过程中，证据的收集至关重要。您需要尽可能收集与充值、店铺倒闭及老板跑路相关的所有证据，如充值记录、合同、收据、店铺关闭的照片或视频、与老板的沟通记录等。
   • 分析：充分的证据是胜诉的关键。若您能提供确凿的证据证明您曾在该美容店充值且店铺倒闭、老板跑路，将大大增加您追讨损失的成功率。

3. 法律途径选择：

   • 您可以选择向法院提起民事诉讼，要求老板返还充值款项及可能的利息或损失赔偿。在诉讼过程中，您需要明确诉讼请求、事实和理由，并提交相关证据。
   • 若老板下落不明或无法联系，您可能需要通过公告送达等方式进行诉讼，并可能面临执行难度较大的问题。在此情况下，您可以考虑申请法院强制执行，如查封、扣押、拍卖老板的财产等。
   • 分析：法律途径是追讨损失的有效手段，但需考虑诉讼成本、时间成本及执行难度等因素。若老板确实无财产可供执行，您可能面临无法全额追回损失的风险。

4. 其他建议：

   • 在尝试法律途径的同时，您也可以考虑向消费者协会或相关监管部门投诉，寻求他们的帮助和支持。
   • 若您与其他受害者有联系，可以联合起来共同追讨损失，增加追讨的成功率和影响力。
   • 分析：多渠道追讨损失可能增加成功的机会。消费者协会和监管部门可能能提供一定的帮助和支持，而联合其他受害者则可以形成更大的力量。

行动建议：

• 尽快收集相关证据，包括充值记录、合同、收据等，以证明您的充值事实和损失情况。
• 咨询专业律师（即我，高雅琪律师，专注于合同纠纷、经济纠纷、公司事务领域），了解具体的法律途径和诉讼策略。
• 根据律师的建议，决定是否向法院提起诉讼，并准备相应的诉讼材料。
• 在诉讼过程中，保持与律师的密切沟通，及时了解案件进展和诉讼结果。

如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。