结论前置：签了分居协议但没有支付抚养费，在诉讼离婚时是可以要求对方偿还的。
详细分析：
分居协议的法律效力：
- 分居协议，如果双方自愿签订，且内容不违反法律法规的强制性规定，通常是具有法律效力的。这意味着协议中的条款，包括抚养费的支付，对双方都有约束力。
抚养费的支付义务：
- 根据相关法律规定，父母对未成年子女有抚养教育的义务。这种义务不因父母是否分居或离婚而消除。因此，即使双方签订了分居协议，不直接抚养子女的一方仍然有义务按照协议或法律的规定支付抚养费。
诉讼离婚时的抚养费追偿：
- 如果在分居期间，一方未按照分居协议支付抚养费，另一方在诉讼离婚时可以提出要求对方偿还的诉求。法院在审理此类案件时，会考虑分居协议的内容、双方的实际情况以及子女的实际需要等因素，来判定是否支持追偿抚养费的请求。
实际操作建议：
- 在诉讼离婚前，建议收集好分居协议、未支付抚养费的证据（如银行转账记录、聊天记录等），以便在诉讼中证明对方未履行支付义务。
- 同时，也可以考虑在诉讼中提出调整抚养费标准的请求，如果认为原协议中的抚养费标准过低或过高，可以根据子女的实际需要和双方的经济状况进行合理调整。
可能遇到的特殊情况及处理：
如果分居协议未明确抚养费金额或支付方式：
- 在这种情况下，法院可能会根据子女的实际需要、父母的经济状况以及当地的生活水平等因素，来判定合理的抚养费金额和支付方式。
如果对方确实无力支付抚养费：
- 如果对方因为失业、疾病等原因确实无力支付抚养费，法院可能会考虑减免部分或全部抚养费。但这种情况需要对方提供充分的证据来证明其无力支付的事实。
后续行动建议：
- 如果你正面临这样的情况，建议尽快咨询专业律师（即向我咨询），以便更详细地了解你的权利和义务，以及如何在诉讼中有效地维护你的合法权益。
- 同时，也要保持冷静和理性，通过法律途径来解决问题，避免采取过激或违法的行为。