结论：公司将村民承包经营权抵押登记是否违法，不能一概而论，需根据具体情况判断，主要涉及承包经营权是否可抵押、抵押是否经过法定程序以及是否损害村民利益等关键因素。以下从不同角度详细分析：

一、承包经营权是否可抵押

1. 法律规定：

   • 根据《中华人民共和国民法典》及相关法律法规，农村土地承包经营权在特定条件下是可以抵押的。例如，通过招标、拍卖、公开协商等方式承包农村土地，经依法登记取得土地承包经营权证或者林权证等证书的，其土地承包经营权可以依法采取转让、出租、入股、抵押或者其他方式流转。
   • 但对于家庭承包方式取得的土地承包经营权，其抵押则受到更为严格的限制，通常需要满足特定条件，如承包方已流转出其承包的土地经营权，或者承包方有稳定的非农职业或者有稳定的收入来源等。

2. 实际情况分析：

   • 如果公司抵押的村民承包经营权属于可以通过招标、拍卖、公开协商等方式取得的，并且已经依法登记取得相关证书，那么这种抵押行为在法律上是允许的。
   • 如果公司抵押的是家庭承包方式取得的土地承包经营权，且未满足特定条件，那么这种抵押行为可能涉嫌违法。

二、抵押是否经过法定程序

1. 法定程序要求：

   • 抵押承包经营权需要遵循一定的法定程序，包括签订抵押合同、办理抵押登记等。这些程序旨在保障抵押权的合法性和有效性，同时保护抵押人和抵押权人的合法权益。

2. 实际情况分析：

   • 如果公司在抵押承包经营权时，未按照法定程序进行，如未签订抵押合同或未办理抵押登记，那么这种抵押行为可能因程序违法而无效。
   • 即使公司按照法定程序进行了抵押，但如果抵押合同内容存在违法或不合理之处，也可能影响抵押的合法性。

三、是否损害村民利益

1. 村民利益保护：

   • 在抵押承包经营权的过程中，必须充分考虑和保护村民的利益。如果抵押行为导致村民失去土地承包经营权，且未得到合理补偿或安置，那么这种抵押行为可能因损害村民利益而违法。

2. 实际情况分析：

   • 如果公司在抵押承包经营权时，与村民进行了充分协商，并确保了村民的合法权益得到保障，如提供了合理的补偿或安置方案，那么这种抵押行为在法律上可能是允许的。
   • 如果公司未经村民同意或未提供合理补偿就擅自抵押承包经营权，那么这种行为可能涉嫌违法，并可能引发法律纠纷。

建议：

• 对于公司而言，在抵押村民承包经营权前，应仔细审查相关法律法规和政策规定，确保抵押行为的合法性和有效性。同时，应与村民进行充分协商，确保村民的合法权益得到保障。
• 对于村民而言，如果发现公司未经同意或未提供合理补偿就擅自抵押其承包经营权，应及时向相关部门投诉或寻求法律援助，以维护自己的合法权益。

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