结论：电商包邮商品可以一起开发票，且这种做法是合法的。以下从不同角度为你详细分析：
从发票开具的法律规定角度 根据《中华人民共和国发票管理办法》及相关税收法规，销售商品、提供服务以及从事其他经营活动的单位和个人，对外发生经营业务收取款项，收款方应当向付款方开具发票。在电商交易中，包邮商品的销售属于经营业务，商家有义务为消费者开具发票。这里的“包邮”只是商家的一种促销或服务方式，并不影响商品销售这一本质交易行为。只要消费者支付了商品价款（包含在包邮价格中），商家就必须按照实际交易情况开具发票，将商品价款和运费（如果运费实际包含在售价中且需体现）等项目清晰列明。所以，将包邮商品一起开具发票是符合法律规定的。
从消费者权益保护角度 发票是消费者购买商品的重要凭证，具有证明交易关系、保障售后服务、维护自身合法权益等多方面作用。对于包邮商品，消费者同样享有获得发票的权利。如果商家拒绝为包邮商品开具发票，或者要求消费者额外支付费用才开具发票，这无疑损害了消费者的合法权益。消费者有权依据相关法律法规，要求商家履行开具发票的义务，以保障自己在购买商品后的各项权益，如退换货、质量保证等。
从税务管理角度 对于商家而言，正确开具发票是其履行纳税义务的重要环节。将包邮商品一起开具发票，有助于商家准确核算销售收入和成本，按照规定申报纳税。税务机关也可以通过商家开具的发票信息，对其经营活动进行监管，确保税收征管的准确性和有效性。如果商家不按规定开具发票，可能会面临税务机关的处罚，包括罚款、加收滞纳金等。
在实际操作中，如果遇到商家拒绝为包邮商品开具发票的情况，消费者可以先与商家沟通协商，要求其履行开具发票的义务。如果商家仍然拒绝，消费者可以向当地税务机关举报，税务机关会依法进行处理。如果你在电商交易中遇到其他法律问题，也可以直接向我咨询。