在男方起诉离婚且有两个小孩的情况下，法院一般会从子女权益最大化原则出发，结合双方经济条件、抚养能力、子女成长环境等因素，对子女抚养权归属及抚养费支付等问题作出判决。具体处理方式如下：

1. 子女抚养权归属

   • 两周岁以下子女：原则上归母亲直接抚养，除非母亲存在严重不利于子女成长的情形（如疾病、虐待等）。
     
   • 两周岁至八周岁子女：法院会综合比较双方抚养条件（如经济能力、教育背景、陪伴时间等），优先判决给更有利于子女成长的一方。若双方条件相当，可能判决轮流抚养或由一方直接抚养，另一方享有探视权。
     
   • 八周岁以上子女：法院会尊重子女本人意愿，结合其他因素综合判断抚养权归属。
     

2. 抚养费支付

   • 支付标准：根据子女实际需求、父母负担能力及当地生活水平确定，一般按月总收入的20%-30%支付（有多个子女时比例可适当提高，但不超过50%）。
     
   • 支付方式：可一次性支付或定期支付（如按月、按季），具体由双方协商或法院判决。
     
   • 调整机制：若抚养方经济状况显著变化或子女需求增加，可向法院申请调整抚养费金额。
     

3. 探视权保障

   • 未直接抚养子女的一方享有探视权，法院会明确探视时间、方式（如每周一次、节假日轮流等），确保子女与父母保持情感联系。
     
   • 若一方阻碍探视，另一方可申请法院强制执行或变更抚养权。
     

4. 其他特殊情形

   • 若一方存在家暴、出轨、赌博等过错行为，法院可能倾向于将子女判归无过错方抚养。
     
   • 若双方协商一致由一方抚养子女，法院一般会尊重双方意愿，但需确保协议内容符合子女利益。
     

建议：若您面临此类纠纷，可提前收集证据（如收入证明、陪伴记录、子女意愿表达等），并在诉讼中积极主张自身抚养优势。如有具体问题，可直接向我咨询，我会结合您的实际情况提供详细解答。