超过六十周岁的农民工被辞退是否有补偿，需综合考虑员工是否达到法定退休年龄、是否享受养老保险待遇、辞退原因以及公司是否存在违法行为等多个因素。以下是对这些因素的详细分析：
一、达到法定退休年龄的情况
一般情形：
- 在我国，男性年满60周岁、女性年满50周岁（女干部年满55周岁）即达到法定退休年龄。根据《劳动合同法实施条例》第二十一条，劳动者达到法定退休年龄时，劳动合同终止。此为公司合法终止劳动关系，通常无需支付经济补偿或赔偿金。
特殊情形：
- 未享受养老保险待遇：若因公司拖欠工资、未依法缴纳社会保险等导致员工虽达退休年龄却未能享受养老保险待遇，公司辞退员工可能构成违法解除。此时，公司需按经济补偿标准的二倍支付赔偿金。经济补偿标准按劳动者在本单位工作年限计算，每满一年支付一个月工资；六个月以上不满一年按一年计算；不满六个月支付半个月工资。月工资高于当地职工月平均工资三倍的，补偿年限最高不超过十二年。
- 未办理退休手续：员工虽超60岁但尚未办理退休手续且双方劳动关系未终止，公司单方面辞退可能同样构成违法解除，需支付赔偿金，计算方式同上。
二、未达到法定退休年龄的情况
对于从事特殊工种、退休年龄有所不同的员工，若其虽超过60岁但未达法定退休年龄，辞退赔偿情况与普通员工相同，具体如下：
符合法定情形辞退：
- 若员工存在《劳动合同法》第三十九条规定的情形（如试用期不符合录用条件、严重违反规章制度等），公司辞退无需支付经济补偿或赔偿金。
无过失性辞退：
- 根据《劳动合同法》第四十条，员工患病、不能胜任工作或劳动合同订立时的客观情况发生重大变化等情况下，公司提前三十日通知或额外支付一个月工资后可解除劳动合同，但需支付经济补偿。经济补偿标准同上。
经济性裁员：
- 公司因破产重整、生产经营困难等原因进行经济性裁员时，辞退员工需支付经济补偿。经济补偿标准同样按劳动者在本单位工作年限计算。
违法辞退：
- 若公司辞退员工不符合上述法定情形，属于违法解除劳动合同，应按经济补偿标准的二倍支付赔偿金。
三、建议与注意事项
- 核实退休年龄与养老保险待遇：员工应核实自己是否已达到法定退休年龄，并确认是否享受养老保险待遇。这有助于判断公司辞退是否合法，以及是否有权要求经济补偿或赔偿金。
- 保留相关证据：员工应保留与公司的劳动合同、工资单、社保缴纳记录等相关证据。这些证据在维权过程中至关重要。
- 及时咨询专业律师：若员工对公司辞退行为有异议，或不确定自己是否有权要求经济补偿或赔偿金，可以直接向我咨询。我将根据具体情况提供专业的法律建议。
综上所述，超过六十周岁的农民工被辞退是否有补偿，需根据具体情况进行判断。员工应了解自己的权益，并在必要时寻求法律帮助。