核心结论：村支书不给村卫生室所长在岗考勤表盖章，可通过沟通协商、依据制度规定处理、寻求上级部门帮助或通过法律途径解决，具体如下：

1. 沟通协商
   • 了解原因：村卫生室所长应首先主动与村支书进行友好、诚恳的沟通，询问不盖章的具体原因。有可能是村支书对考勤情况存在疑问，比如认为考勤记录不真实、不完整，或者存在其他误解。例如，村支书可能发现某段时间的考勤记录与实际出勤情况不符，有虚报、漏报的情况，所以拒绝盖章。通过沟通，所长可以明确问题所在，为后续解决提供方向。
   • 解释说明：如果是因为村支书对考勤情况不了解或有误解，所长应详细解释考勤的记录方式、依据以及实际出勤情况。可以提供相关的证据，如监控录像、同事的证言等，以证明考勤记录的真实性和准确性。比如，如果考勤是通过打卡机记录的，可以向村支书展示打卡记录；如果是人工记录，可以请当时在场的同事作证。
2. 依据制度规定处理
   • 查看村规民约或相关制度：村里一般会有村规民约或者相关的管理制度，其中可能对考勤盖章的流程和要求有明确规定。所长应仔细查阅这些制度，确定村支书是否有合理的理由拒绝盖章。如果制度规定村支书必须在考勤表真实、准确的情况下盖章，而所长能够证明考勤表符合要求，那么村支书的行为可能违反了制度规定。
   • 按照制度流程申诉：如果村支书的行为违反了村规民约或相关制度，所长可以按照制度规定的流程进行申诉。例如，有些村规定可以向村委会的其他成员或者村民代表大会反映情况，由他们进行调查和裁决。所长应准备好相关的证据和材料，向申诉机构说明情况，要求村支书按照制度规定盖章。
3. 寻求上级部门帮助
   • 向乡镇政府反映：如果沟通协商和依据制度规定处理都无法解决问题，所长可以向所在的乡镇政府反映情况。乡镇政府对村里的工作有指导和监督的职责，他们可以介入调查，了解事情的真相，并协调村支书和所长之间的关系，促使问题得到解决。所长在向乡镇政府反映时，应提供详细的情况说明和相关证据，以便乡镇政府能够准确了解问题。
   • 向卫生主管部门求助：由于村卫生室属于医疗卫生机构，所长还可以向当地的卫生主管部门求助。卫生主管部门对村卫生室的管理有相应的职责，他们可以从专业角度对考勤情况进行评估，并协调村支书履行盖章的职责。例如，卫生主管部门可以要求村支书说明不盖章的理由，如果理由不充分，可以责令其盖章。
4. 法律途径
   • 行政诉讼（如果涉及行政行为）：如果村支书的行为被认定为一种行政行为（这种情况相对较少，但在某些特定情况下可能存在，比如村支书受乡镇政府委托行使一定行政管理职责），且该行为侵犯了所长的合法权益，所长可以考虑提起行政诉讼。不过，这种情况需要严格符合行政诉讼的受理条件，所长应咨询专业法律人士，确定是否符合起诉条件。
   • 民事诉讼（如果造成经济损失）：如果村支书不盖章的行为给所长造成了经济损失，比如因为无法提供完整的考勤记录而导致工资被扣减等，所长可以以侵权为由向法院提起民事诉讼，要求村支书赔偿相应的经济损失。在提起民事诉讼时，所长需要提供证据证明村支书的行为与经济损失之间存在因果关系。