若在厂里发工资时发现现金中有假币并已报警，处理流程及法律要点如下：

1. 警方介入后的调查程序
   警方会首先对假币进行扣押并鉴定真伪（依据《中国人民银行法》第42条，制造、使用假币属违法行为）。若确认是假币，警方会立案侦查，重点调查假币来源：

   • 若假币来自工厂财务部门（如出纳误收或故意使用），工厂可能涉嫌“持有、使用假币罪”（刑法第172条），单位直接负责的主管人员和其他责任人员可能被追责；
     
   • 若假币是员工私自混入工资中（如员工用假币替换真币），则员工个人涉嫌“使用假币罪”，需承担刑事责任。
     

2. 员工的权利与救济途径

   • 工资补发请求权：根据《工资支付暂行规定》第5条，工资应以法定货币支付。若因假币导致员工实际未收到足额工资，员工有权要求工厂在3个工作日内补发差额（需保留工资条、假币等证据）；
     
   • 举报权：若怀疑工厂故意使用假币，员工可向当地公安机关经侦部门或人民银行举报（依据《中华人民共和国人民币管理条例》第32条，任何单位和个人不得拒收人民币，但故意使用假币除外）；
     
   • 劳动仲裁申请：若工厂拒绝补发工资或存在其他劳动争议（如未签劳动合同、未缴社保等），员工可在离职后1年内申请劳动仲裁，主张工资差额及经济补偿金。
     

3. 工厂的合规义务与风险防范

   • 现金管理规范：工厂应建立严格的现金收支制度，例如要求财务人员通过银行验钞机清点工资、保留现金来源凭证（如银行取款回单）；
     
   • 假币处理流程：发现假币后应立即隔离并标记，避免再次流通，同时配合警方调查；
     
   • 员工沟通机制：若因假币导致工资发放延误，工厂需及时向员工说明情况并出具书面承诺，避免引发群体性纠纷。
     

温馨提示：若您或同事遇到此类情况，建议第一时间拍照/录像固定假币证据，并联合其他员工共同与工厂协商。如协商无果，可携带工资条、假币、报警回执等材料向我咨询具体维权方案。