若挂靠分包协议被认定为无效，首先需明确的是，协议无效后，因该协议取得的财产应当予以返还，不能返还或者没有必要返还的，应当折价补偿。有过错的一方应当赔偿对方因此所受到的损失，双方都有过错的，应当各自承担相应的责任。以下是从不同角度对这一问题的详细分析：
协议无效的原因及法律后果：
- 原因：挂靠分包协议可能因违反法律法规的强制性规定（如未经许可的挂靠行为、分包给不具备相应资质的单位等）而被认定为无效。
- 法律后果：根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，无效的民事法律行为自始没有法律约束力。因此，挂靠分包协议一旦被认定无效，双方基于该协议所进行的交易、支付等行为均可能面临法律上的挑战。
财产返还与折价补偿：
- 财产返还：若因挂靠分包协议取得了财产（如工程款、材料款等），在协议无效后，应当予以返还。这通常涉及双方之间的财务结算和款项退还。
- 折价补偿：若财产无法返还或没有必要返还（如已消耗的材料、已完成的工程部分等），则应当根据实际情况进行折价补偿。这可能需要通过评估、鉴定等方式确定补偿金额。
过错责任与损失赔偿：
- 过错责任：在挂靠分包协议无效的情况下，双方均可能存在一定的过错。例如，挂靠方可能明知自身不具备资质仍进行挂靠，分包方可能明知挂靠行为违法仍进行分包。
- 损失赔偿：有过错的一方应当赔偿对方因此所受到的损失。这包括直接损失（如已支付的款项、已采购的材料等）和间接损失（如因协议无效导致的工期延误、额外费用支出等）。若双方都有过错，则应当根据各自的过错程度承担相应的责任。
实际操作中的建议：
- 及时沟通：在发现挂靠分包协议可能无效时，双方应及时沟通，明确各自的权利和义务，以及协议无效后的处理方式。
- 收集证据：双方应收集与协议签订、履行相关的所有证据，包括合同文本、支付凭证、沟通记录等，以便在后续处理中证明自己的主张。
- 寻求法律帮助：由于挂靠分包协议无效后的处理涉及复杂的法律问题，建议双方寻求专业律师的帮助，以确保自己的权益得到妥善保护。
在处理挂靠分包协议无效的问题时，双方应保持冷静和理性，通过协商、调解或诉讼等方式妥善解决争议。若你有任何具体的法律问题或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。