股东损害公司利益责任纠纷在执行终本后的诉讼时效通常为三年。以下是对此问题的详细分析：
一、诉讼时效的基本规定
根据《中华人民共和国民法典》第一百八十八条的规定，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。这一规定同样适用于股东损害公司利益责任纠纷案件。诉讼时效期间自权利人（即公司或其他股东）知道或者应当知道权利受到损害以及义务人（即损害公司利益的股东）之日起计算。
二、执行终本对诉讼时效的影响
执行终本，即执行程序终结，通常意味着法院已经对案件进行了执行，但由于某种原因（如被执行人无财产可供执行等）而暂时无法继续执行。执行终本本身并不直接影响诉讼时效的计算。诉讼时效的计算仍然是从权利人知道或应当知道权利受到损害之日起开始，持续三年。
三、诉讼时效的起算点
一般情形：
- 在股东损害公司利益责任纠纷中，诉讼时效的起算点通常是权利人发现或应当发现自己的权益受到损害，并且知道了具体的损害行为人和损害事实之时。例如，如果公司发现某股东通过不正当手段转移了公司资产，导致公司利益受损，那么从公司发现这一事实之日起，诉讼时效开始计算。
特殊情形：
- 如果法律规定了其他起算点，如从特定事件发生之日起计算，则按照该规定执行。但在股东损害公司利益责任纠纷中，这种情况相对较少见。
四、诉讼时效的中止与中断
中止：
- 在诉讼时效期间的最后六个月内，如果因不可抗力或其他障碍导致权利人不能行使请求权，诉讼时效将中止。自中止时效的原因消除之日起满六个月，诉讼时效期间届满。例如，如果公司因自然灾害等不可抗力原因无法及时提起诉讼，那么诉讼时效将中止，直到公司能够恢复行使请求权为止。
中断：
- 如果在诉讼时效期间内，权利人向义务人提出履行请求、义务人同意履行义务、权利人提起诉讼或申请仲裁等情形之一发生，诉讼时效将中断并重新计算。例如，如果公司向损害其利益的股东发出书面通知要求赔偿损失，或者股东同意赔偿并签订了赔偿协议，那么诉讼时效将从这些行为发生之日起重新计算。
五、注意事项
及时主张权利：
- 公司或其他股东应在诉讼时效期间内及时向损害公司利益的股东主张权利，否则可能因超过诉讼时效而丧失胜诉权。
保留证据：
- 公司或其他股东应妥善保留与股东损害行为相关的证据材料，如财务报表、交易记录、合同协议等，以便在诉讼中证明自己的权益受到侵害。
法律咨询：
- 由于股东损害公司利益责任纠纷案件涉及复杂的法律问题，如果你在处理此类案件时遇到任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。
综上所述，股东损害公司利益责任纠纷在执行终本后的诉讼时效通常为三年，但具体起算点可能因案件情况而有所不同。在处理此类纠纷时，建议公司或其他股东及时主张权利并保留相关证据材料。如有需要，请随时向我咨询以获取专业的法律帮助。