确认劳动关系提出时效抗辩确实需要查清事实。以下从几个方面为你详细分析：

1. 时效抗辩的基础是事实认定：

   • 在劳动争议中，当一方提出时效抗辩时，其核心在于主张对方的主张已经超过了法定的时效期间。然而，这一抗辩的成立必须建立在准确的事实认定基础之上。即，需要查清双方建立劳动关系的时间、争议发生的时间以及对方主张权利的时间等关键事实。
   • 如果这些事实无法查清，或者存在争议，那么时效抗辩就难以成立。因为，时效的计算必须基于明确的事实起点和终点。

2. 查清事实是法律适用的前提：

   • 在劳动争议处理中，法律适用必须建立在准确的事实认定之上。如果事实不清，那么法律适用就可能出错，导致不公正的裁决。
   • 对于时效抗辩而言，同样需要查清事实以确定是否超过了法定的时效期间。这包括查清劳动关系的建立时间、争议的发生时间以及对方是否在时效期间内主张了权利等。

3. 实务操作中的考虑：

   • 在实务操作中，仲裁机构或法院在处理劳动争议时，通常会要求双方提供证据以证明各自的主张。对于时效抗辩而言，提出抗辩的一方需要提供证据证明对方的主张已经超过了法定的时效期间。
   • 如果提出抗辩的一方无法提供充分的证据证明其主张，或者对方能够提供反驳证据证明其主张未超过时效期间，那么时效抗辩就可能被驳回。

4. 可能的法律后果：

   • 如果时效抗辩成立，即对方的主张确实超过了法定的时效期间，那么对方的主张可能不会被支持。这意味着，提出抗辩的一方可能无需承担相应的法律责任。
   • 然而，如果时效抗辩不成立，即对方的主张未超过法定的时效期间，那么对方的主张可能会得到支持。这意味着，提出抗辩的一方可能需要承担相应的法律责任。

建议：

• 在处理劳动争议时，如果一方提出时效抗辩，双方都应积极提供证据以证明各自的主张。这有助于仲裁机构或法院准确查清事实，从而作出公正的裁决。
• 如果你作为劳动者或用人单位，在面临劳动争议时不确定如何处理时效抗辩问题，可以直接向我咨询。我会根据你的具体情况，为你提供专业的法律建议和帮助。