关于甲方扣除乙方税点是否合法的问题，这并非一个简单的“是”或“否”的答案，而是需要根据具体情况来详细分析。以下是我从不同角度为你提供的详细解答：

1. 合同约定角度：

   • 如果甲乙双方在合同中明确约定了甲方可以扣除乙方税点，并且这种约定不违反法律法规的强制性规定，那么这种扣除行为在合同层面上是合法的。
   • 关键点：合同是双方意思自治的体现，只要不违反法律、行政法规的强制性规定，合同条款即具有法律效力。因此，合同中是否有明确约定是判断扣除行为是否合法的首要依据。

2. 税收法规角度：

   • 税收法规规定了纳税义务人和扣缴义务人的责任。在一般情况下，乙方作为提供服务或商品的一方，是纳税义务人，应当自行申报并缴纳税款。
   • 如果甲方作为支付方，被税务机关指定为扣缴义务人，那么甲方有义务按照税法规定扣缴乙方的税款。但这种情况下，扣除的税点应当是税法规定的税率，而不是甲方随意确定的。
   • 关键点：甲方扣除的税点必须符合税法规定的税率，且甲方必须是被税务机关指定为扣缴义务人，否则甲方无权随意扣除乙方税点。

3. 公平交易角度：

   • 从公平交易的角度来看，甲方扣除乙方税点应当基于合理的商业理由，并且不得损害乙方的合法权益。
   • 如果甲方扣除的税点过高，导致乙方实际获得的报酬远低于市场水平，那么这种扣除行为可能构成不公平交易，乙方有权提出异议。
   • 关键点：扣除行为应当合理且公平，不得损害乙方的合法权益。如果扣除行为导致交易显失公平，乙方可以寻求法律救济。

4. 实际操作建议：

   • 对于乙方而言，在签订合同时应当仔细审查合同条款，特别是关于税款扣除的约定。如果合同中没有明确约定或者约定不明确，乙方有权要求甲方明确说明扣除的税点和依据。
   • 如果乙方认为甲方扣除的税点不合理或者违法，可以与甲方进行协商，要求甲方停止扣除或者调整扣除的税点。如果协商无果，乙方可以向税务机关投诉或者寻求法律救济。

总结来说，甲方扣除乙方税点是否合法取决于合同约定、税收法规以及公平交易原则。如果合同中有明确约定且符合税法规定，同时扣除行为合理且公平，那么这种扣除行为是合法的。否则，乙方有权提出异议并寻求法律救济。如果你在实际操作中遇到相关问题，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况为你提供更详细的法律建议。