您好，关于您提出的“甲方代扣代缴是否合法”的问题，这主要取决于具体的情境和相关的法律法规。一般来说，在税收法律、行政法规明确规定的情况下，甲方作为负有扣缴义务的单位或个人，进行代扣代缴是合法的。
首先，我们来明确一下代扣代缴的定义。根据国家税务总局、财政部和中国人民银行联合发布的通知，代扣代缴是指税收法律、行政法规已经明确规定负有扣缴义务的单位和个人，在支付款项时，代税务机关从支付给负有纳税义务的单位和个人的收入中扣留，并向税务机关解缴的行为。
接下来，我们分析代扣代缴的合法性依据：
法律法规明确规定：代扣代缴的合法性首先来源于税收法律、行政法规的明确规定。只有当法律、行政法规明确规定了某单位或个人负有代扣代缴义务时，该单位或个人才能进行代扣代缴。
税务机关的登记与管理：税务机关会依据国家税务总局的有关规定，对负有代扣代缴、代收代缴的扣缴义务人办理登记。这进一步确保了代扣代缴行为的合法性和规范性。
手续费支付与管理：对于代扣代缴行为，税务机关会按照规定的比例支付手续费，并对手续费进行严格的管理。这既是对扣缴义务人的一种补偿，也是对其代扣代缴行为的一种监督和管理。
现在，我们回到您的问题上。如果甲方是税收法律、行政法规明确规定的负有代扣代缴义务的单位或个人，并且已经按照税务机关的要求进行了登记和管理，那么甲方进行代扣代缴就是合法的。
但是，如果甲方没有法律、行政法规的明确规定作为依据，或者没有按照税务机关的要求进行登记和管理，那么甲方进行代扣代缴就可能是不合法的。在这种情况下，甲方可能会面临税务机关的处罚和法律责任。
因此，我建议您在确认甲方是否可以进行代扣代缴时，先查阅相关的税收法律、行政法规，并咨询当地的税务机关或专业律师的意见。这样可以确保您的权益得到保障，并避免不必要的法律风险。