关于超市员工直接离职违约金如何计算的问题，需分情况讨论，核心结论如下：

1. 若劳动合同或规章制度未约定违约金
   根据《劳动合同法》第二十五条，除两种法定情形外（服务期违约金、竞业限制违约金），用人单位不得与劳动者约定由劳动者承担违约金。因此，若超市未与员工签订专项培训协议（约定服务期）或未约定竞业限制条款，员工直接离职无需支付违约金。

2. 若存在服务期约定（如专项培训）
   根据《劳动合同法》第二十二条，用人单位为劳动者提供专项培训费用并约定服务期的，劳动者违反服务期约定需支付违约金。违约金计算方式为：
   违约金金额 = 未履行服务期天数 ÷ 总服务期天数 × 专项培训总费用
   例如：培训总费用3万元，约定服务期3年（1095天），员工工作1年后离职，则违约金= (1095-365)÷1095×30000≈2万元。
   注意：违约金不得超过服务期未履行部分所应分摊的培训费用。

3. 若存在竞业限制约定
   根据《劳动合同法》第二十三条，对负有保密义务的劳动者，用人单位可约定竞业限制条款并支付经济补偿。若劳动者违反竞业限制义务，需按约定支付违约金。但需满足以下条件：

   • 竞业限制人员限于高级管理人员、技术人员等负有保密义务的人员；
     
   • 竞业限制期限不得超过2年；
     
   • 用人单位需在竞业限制期内按月支付经济补偿（通常为离职前月工资的30%-50%）。
     若超市未支付经济补偿，劳动者可主张竞业限制条款无效，无需支付违约金。

4. 若超市以“直接离职造成损失”为由索赔
   根据《工资支付暂行规定》第十六条，若劳动者因故意或重大过失给用人单位造成经济损失，用人单位可要求赔偿，但每月扣除部分不得超过当月工资的20%。但需注意：

   • 超市需举证证明实际损失与员工离职存在直接因果关系；
     
   • 赔偿范围仅限于直接经济损失（如临时招聘成本、货物损耗等），不包括预期利益损失。

实务建议：

• 员工离职前应提前30日（试用期3日）书面通知超市，履行法定义务；
  
• 若超市主张违约金，可要求其出示劳动合同、培训协议或竞业限制协议等书面证据；
  
• 若对违约金合法性存疑，可向当地劳动监察大队投诉或申请劳动仲裁。
  

如有具体合同条款或纠纷细节，可进一步提供信息以便针对性分析。