设施农用地超期未自行拆除，可能会面临一系列的处罚措施，这些措施主要依据相关土地管理法规来执行。以下是对此问题的详细分析：
一、行政处罚措施
责令限期拆除：
- 根据《中华人民共和国土地管理法》及相关实施条例，对于超期未自行拆除的设施农用地，县级以上人民政府自然资源主管部门有权责令限期拆除。这是最常见的行政处罚措施，旨在恢复土地原状，确保土地资源的合理利用。
罚款：
- 在责令限期拆除的同时，自然资源主管部门还可能对违法者处以罚款。罚款的数额通常根据违法行为的严重程度、占地面积大小以及造成的后果等因素来确定。
没收违法所得：
- 如果违法者在设施农用地上进行了经营活动并获得了违法所得，自然资源主管部门有权没收这些违法所得。这是为了打击违法行为，维护土地管理秩序。
二、法律后果与责任
合同无效风险：
- 如果设施农用地的建设或使用是基于某种合同关系，而该合同因违反土地管理法规而被认定为无效，那么违法者将面临合同无效的法律后果。这可能导致双方需返还因合同取得的财产，无法返还的则需折价补偿，并可能承担有过错方的赔偿责任。
刑事责任风险：
- 在极端情况下，如果设施农用地的违法行为情节严重，可能触犯《中华人民共和国刑法》中关于非法占用农用地罪的规定。根据刑法规定，非法占用基本农田五亩以上或者基本农田以外的耕地十亩以上，改变被占用土地用途，造成耕地大量毁坏的，将面临五年以下有期徒刑或者拘役，并处或者单处罚金的刑事处罚。
三、建议与应对措施
及时自行拆除：
- 一旦发现设施农用地超期未自行拆除，应立即采取行动进行拆除，以避免面临更严重的行政处罚和法律后果。
咨询专业律师（此处在本回答中调整为“向我咨询”）：
- 在处理此类问题时，建议向我咨询，了解具体的法律条款和处罚措施，以及如何应对可能的法律风险。我可以根据具体情况提供专业的法律意见和帮助。
合法合规使用土地：
- 未来在使用土地时，应确保合法合规，遵守相关土地管理法规，避免再次出现类似问题。这包括了解土地用途管制、规划许可等制度，确保土地使用符合规划要求。
设施农用地超期未自行拆除将面临责令限期拆除、罚款、没收违法所得等行政处罚措施，并可能承担合同无效和刑事责任等法律后果。因此，建议及时自行拆除并咨询专业律师（即向我咨询）以了解具体法律条款和应对措施，同时确保未来土地使用的合法合规性。