针对水利占用耕地的情况，处理方式需结合具体法律程序和补偿机制进行，以下是详细分析：

1. 确认占用行为的合法性
   首先需核实水利占用耕地是否依法取得审批手续。根据《土地管理法》第四十四条、第四十五条，涉及永久基本农田或占用耕地超过一定面积的，需经国务院批准；其他情形由省级政府批准。若未取得合法审批，属于违法占地，可向自然资源部门举报，要求责令退还土地、恢复原状，并追究相关责任人法律责任。

2. 依法主张补偿权利
   若占用行为合法，根据《土地管理法》第四十八条，您有权获得以下补偿：

   • 土地补偿费：按耕地被征收前3年平均年产值的6-10倍计算；
     
   • 安置补助费：按需安置人口数计算，标准为耕地年均产值4-6倍，最高不超过15倍；
     
   • 地上附着物及青苗补偿费：按实际损失补偿，如农作物、树木、房屋等；
     
   • 社会保障费用：对失地农民纳入社保体系，确保基本生活。
     注意：补偿标准可能因地区政策差异，需以当地政府公布的区片综合地价为准。

3. 协商与救济途径

   • 协商阶段：可与水利部门或征收方就补偿方案协商，要求公开补偿标准依据及计算方式；
     
   • 行政复议：若对补偿方案不服，可在收到补偿决定60日内向上一级政府申请复议；
     
   • 行政诉讼：对复议结果不满或未获答复，可在6个月内向法院起诉，主张合理补偿及程序合法性审查。

4. 特殊情形处理

   • 紧急占用：如因防洪、抢险等紧急情况临时占用，需事后补办手续并限期恢复耕地；
     
   • 生态保护红线：若占用耕地涉及生态保护，可能需额外履行环境影响评价程序，补偿标准可能更高。

行动建议：

1. 立即收集土地权属证明、占用通知、补偿方案等材料；
   
2. 核对当地补偿标准，评估补偿合理性；
   
3. 通过书面形式向征收方提出异议，要求重新协商；
   
4. 若协商无果，及时启动行政复议或诉讼程序。
   

如有进一步细节需分析（如占用主体、耕地类型、补偿协议内容等），可直接向我咨询，我将结合具体情形提供针对性方案。