关于电瓶车在地下车库充电是否合法的问题，这主要取决于当地的消防安全法规以及具体的管理规定。以南京市为例，我们可以根据《南京市电动自行车消防安全管理办法》来进行详细解读。

首先，需要明确的是，《南京市电动自行车消防安全管理办法》中明确规定了电动自行车在不符合消防安全要求的室内（含地下室、半地下室、储藏间）停放或充电是被禁止的。这一规定主要是出于消防安全考虑，因为地下车库等密闭空间一旦发生火灾，后果往往十分严重，且救援难度较大。

具体来说，如果地下车库的充电设施、消防设施以及整体环境等不符合消防安全要求，那么电瓶车在此充电就是不合法的。这包括但不限于充电设施是否具备过载保护、短路保护等安全功能，地下车库是否配备了足够的灭火器材和应急照明设备，以及是否有有效的排烟系统等。

此外，即使地下车库的充电设施和消防设施都符合要求，车主在充电时也需要严格遵守相关规定，比如不得私拉乱接电线、不得在充电过程中离开车辆等，以确保充电过程的安全。

对于其他地区，虽然具体的法规可能有所不同，但消防安全的原则是相通的。因此，建议车主在充电前先了解当地的相关法规和管理规定，确保自己的充电行为合法且安全。

总的来说，电瓶车在地下车库充电是否合法，需要综合考虑当地的消防安全法规、地下车库的具体条件以及充电过程中的安全措施等多个因素。为了保障自己和他人的安全，车主应严格遵守相关规定，选择合法且安全的充电方式。