使用的网站名称已是别人注册的商标，确实存在侵权的风险，但具体是否构成侵权需结合实际情况判断。以下从多个角度为你详细分析：
一、商标法角度
相似性判断：
- 若网站名称与他人注册商标的文字、图形、字母、数字等要素高度相似，甚至完全相同，且整体视觉效果也近似，那么很可能构成侵权。例如，直接将“耐克”作为运动鞋销售网站的名称，显然构成侵权。
- 若网站名称仅包含他人注册商标的部分文字，但整体上仍易使相关公众产生混淆，也可能构成侵权。比如，将“康师傅”稍作修改为“康帅傅”作为方便面销售网站的名称。
商品或服务类别判断：
- 若网站提供的商品或服务与他人注册商标核定使用的商品或服务相同或类似，则侵权风险增加。例如，在服装类商品上注册的商标，若被用于服装销售网站的名称中，可能构成侵权。
- 若网站提供的商品或服务与注册商标核定使用的类别完全不同，且不会使相关公众产生混淆，则通常不构成侵权。
混淆可能性判断：
- 需考虑网站名称的使用是否足以使相关公众对商品或服务的来源产生误认。这包括网站名称的知名度、显著性、使用方式等因素的综合考量。
- 若网站名称具有较高的知名度，且显著区别于他人注册商标，且使用方式不会使相关公众产生混淆，则可能不构成侵权。
二、不构成侵权的情形
在先权利冲突：
- 若网站名称的注册或使用早于他人商标的申请或注册日期，且已具有一定知名度，可能基于在先权利原则不构成侵权。但这种情况较为复杂，需具体分析。
描述性使用：
- 若网站名称仅是对商品或服务的描述性使用，且该描述不涉及他人注册商标的显著部分，通常不构成侵权。例如，“苹果水果销售网”（假设“苹果”未被注册为水果类商标），通常不构成侵权。但需注意，若“苹果”已被注册为水果类商标，且该网站名称的使用方式易使相关公众产生混淆，则可能构成侵权。
非商业性使用：
- 若网站名称的使用不具有商业目的，如个人博客、非营利组织网站等，且未造成混淆，一般不构成侵权。但需注意，若网站名称的使用方式涉及商业宣传或推广，即使网站本身不直接销售商品或服务，也可能构成侵权。
三、风险防范建议
检索查询：
- 在确定网站名称前，应进行商标检索查询，避免使用与他人注册商标相同或近似的名称。这可以通过国家知识产权局商标局官网或其他专业商标检索平台进行。
获得授权：
- 若需使用他人注册商标作为网站名称，应事先获得商标权人的书面授权。这可以确保你的使用行为合法合规，避免侵权风险。
自主创新：
- 尽量创造具有独特性和显著性的网站名称，降低侵权风险。这可以通过结合行业特点、企业文化等因素进行创意设计。
及时咨询：
- 在涉及复杂情况时，如有任何疑问或担忧，可直接向我咨询。作为专业律师，我能够提供更准确的法律判断和处理建议。
综上所述，使用的网站名称已是别人注册的商标是否构成侵权，需结合具体情况从多个角度进行判断。若存在侵权风险，建议及时采取措施进行防范和应对。