结论：施工合同中约定费率任何情况不允许调整，但后期又签订了补充协议的情况下，费率是否可以调整取决于补充协议的具体内容及其法律效力。
分析如下：
合同与补充协议的关系：
- 施工合同与补充协议均属于双方当事人之间的法律文件，具有同等的法律效力。当两者内容存在冲突时，通常遵循“后协议优于先协议”的原则，即补充协议中的条款会覆盖或修改原合同中的相应条款。
补充协议的内容：
- 如果补充协议中明确规定了费率可以调整，并且详细说明了调整的条件、方式、程序等，那么在这种情况下，费率是可以根据补充协议的约定进行调整的。
- 如果补充协议中并未提及费率调整，或者虽然提及但表述模糊、不明确，那么就需要结合原合同的内容、双方当事人的真实意图以及相关法律法规来进行综合判断。
法律效力的考量：
- 补充协议必须是在双方当事人自愿、平等、公平、诚实信用的基础上签订的，且内容不违反法律法规的强制性规定，才具有法律效力。
- 如果补充协议存在欺诈、胁迫、显失公平等情形，或者违反了法律法规的强制性规定，那么该补充协议可能被认定为无效或可撤销，此时费率调整的问题就需要根据原合同或相关法律法规来处理。
实际操作建议：
- 在签订补充协议时，双方当事人应明确约定费率调整的相关条款，包括调整的条件、方式、程序等，以避免后续产生纠纷。
- 如果双方对费率调整存在争议，可以首先尝试通过协商、调解等方式解决；如果协商、调解无果，可以考虑通过诉讼或仲裁等法律途径来解决。
可能涉及的法律后果：
- 如果补充协议有效且明确约定了费率可以调整，那么双方当事人应按照补充协议的约定执行，否则可能构成违约行为，需要承担相应的法律责任。
- 如果补充协议无效或可撤销，或者双方对费率调整存在争议且无法达成一致意见，那么可能需要根据原合同或相关法律法规来处理费率调整的问题，这可能导致双方产生额外的法律成本和风险。
总结与建议：
在施工合同中约定费率任何情况不允许调整后，又签订了补充协议的情况下，费率是否可以调整取决于补充协议的具体内容及其法律效力。因此，建议双方当事人在签订补充协议时务必谨慎对待费率调整的问题，明确约定相关条款以避免后续纠纷。如果双方对费率调整存在争议或无法达成一致意见，可以及时向我咨询以获取专业的法律建议。