结论前置：
- 违章建筑并非超过两年就一定不再处罚，只要其违法状态持续存在，相关部门在任何时候都有权依法对其进行查处和要求限期拆除等处罚措施。
详细分析：
法律依据
《中华人民共和国行政处罚法》：
- 根据该法第三十六条，违法行为在二年内未被发现的，通常不再给予行政处罚；但若涉及公民生命健康安全、金融安全且有危害后果的，这一期限可延长至五年。然而，对于违章建筑而言，由于其违法状态往往是持续存在的（即具有继续状态），因此计算处罚期限时，应从违法状态终了之日起计算，而非从违章建筑建成之日起算。这意味着，只要违章建筑未被拆除，其违法状态就一直在持续，行政机关便有权在任何时候依法对其作出处罚。
《中华人民共和国城乡规划法》：
- 该法并未对违章建筑的查处设定具体的时间限制。只要违章建筑存在且违反了相关法律法规的规定，相关部门就有权对其进行查处，并要求违建者承担相应的法律责任，这包括但不限于罚款和拆除等措施。
实际执法情况
- 在实际执法中，不同地方政府可能会根据当地实际情况和需要，制定具体的执行政策和标准。这些政策和标准可能在某些方面对违章建筑的处理有所细化或补充。但无论如何，只要违章建筑的违法状态持续存在，相关部门都有权依法进行查处。
法律后果与建议
- 法律后果：违章建筑的所有者或相关利益方可能面临罚款、拆除等法律责任。如果违章建筑被拆除，还可能造成经济损失和财产损失。
- 建议：
- 对于违章建筑的所有者或相关利益方而言，建议主动了解并遵守当地的法律法规和政策要求，避免违法建设带来的法律风险和经济损失。
- 如果已经存在违章建筑，建议尽快咨询相关部门或专业律师（即我），了解具体的处理方式和可能的法律后果，以便及时采取措施进行整改或应对。
总结：
违章建筑的处理并不受时间限制，只要其违法状态持续存在，相关部门就有权依法进行查处和处罚。因此，建议所有者或相关利益方务必遵守法律法规，避免违法建设带来的不必要的麻烦和损失。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。