公司自行开发的软件著作权归属问题，主要取决于开发方式、开发者身份以及是否存在相关约定。以下是具体分析：

1. 独立开发情形：

   • 若公司员工在业余时间，且未使用公司任何资源（如资金、设备、未公开的专门信息等）独立开发软件，那么该软件的著作权通常归属于开发者个人。但这种情况较为少见，因为大多数软件开发都会或多或少地利用公司资源或是在工作时间内完成。
   • 示例：公司程序员小李在业余时间，利用自己的电脑和开源软件，独立开发了一款小游戏，该游戏的著作权即归属于小李个人。不过，若小李在开发过程中使用了公司的未公开技术或数据，则可能构成职务作品，著作权归属需另行判断。

2. 职务开发情形：

   • 根据《中华人民共和国著作权法》及《计算机软件保护条例》的相关规定，员工在任职期间，针对本职工作明确指定的开发目标所开发的软件，或作为本职工作活动的自然结果而开发的软件，或主要使用了公司的资金、设备、未公开的专门信息等物质技术条件并由公司承担责任的软件，其著作权归公司所有。
   • 示例：公司软件工程师小王，被公司安排开发一款新的企业管理软件，这是其本职工作任务，因此该软件的著作权归属于公司。

3. 合作开发情形：

   • 若软件由公司内部两个或以上的部门或员工合作开发，其著作权的归属应由合作开发者通过书面合同明确约定。若合同未约定或约定不明确，且软件可分割使用，则各开发者对各自开发的部分单独享有著作权；若软件不可分割使用，则著作权由各合作开发者共同享有，需协商一致行使权利。
   • 示例：公司市场部和技术部合作开发了一款市场分析软件，若双方在合作前签订了书面合同，明确了著作权的归属，则按合同约定执行；若未签订合同或合同未明确约定，则双方需根据各自在软件开发中的贡献和实际情况来判定著作权的归属。

4. 委托开发情形（虽不常见于公司自行开发，但为全面分析，此处也进行说明）：

   • 若公司委托外部个人或第三方进行软件开发，并在委托合同中明确约定软件著作权归属的，按照合同约定执行。通常情况下，如合同规定著作权归公司，则软件完成后著作权属于公司。

建议与注意事项：

• 明确约定：为避免后续因著作权归属问题产生纠纷，建议公司在开发软件前，通过书面形式（如劳动合同、开发协议等）明确约定著作权的归属。
• 保留证据：公司应保留好软件开发过程中的相关证据，如开发记录、任务分配文件、资源使用记录等，以便在发生纠纷时证明自己的权属。
• 及时登记：虽然软件著作权自软件开发完成之日起即自动产生，但进行著作权登记有助于更好地保护公司的权益。登记证书是权利归属的初步证明，有助于在发生纠纷时快速解决争议。

若公司在软件著作权归属问题上遇到任何疑问或纠纷，可以直接向我咨询，我会根据具体情况提供专业的法律意见和帮助。