关于定制开发的软件著作权归谁所有的问题，这是一个涉及软件著作权归属的复杂问题，其答案取决于软件开发的具体情况和相关法律规定。以下是对该问题的详细解答：
结论前置：定制开发的软件著作权归属并非一成不变，而是依据开发过程中的具体情况、相关法律规定以及合同约定来确定。
一、著作权归属的基本原则
独立开发：
- 如果软件是由一方完全独立开发，未利用任何外部单位的物质技术条件，且非执行外部单位任务，那么该软件的著作权归属于该开发者个人或单位。
合作开发：
- 由两个或两个以上的自然人、法人或其他组织合作开发的软件，其著作权的归属应由合作开发者签订书面合同进行约定。若合同未作明确约定或未订立书面合同，则根据软件是否可分割使用来确定著作权的归属：能分割使用的，各开发者对各自开发的部分单独享有著作权；不能分割使用的，由各合作开发者共同享有著作权。
委托开发：
- 当一方接受他人委托开发软件时，著作权的归属应由委托人与受托人通过书面合同进行约定。合同可以明确约定著作权归委托人、受托人或双方共有。若合同未作明确约定或未订立书面合同，根据《著作权法》及《计算机软件保护条例》的规定，著作权默认归属于受托人。
职务开发：
- 开发者在法人或其他组织中任职期间，因执行本职工作或单位任务而开发的软件，且主要利用了单位的物质技术条件，该软件的著作权通常归属于该法人或其他组织。但开发者作为创作者仍享有署名权和获得奖励的权利。
二、特殊情况下的著作权归属
- 国家机关下达任务开发：
- 由国家机关下达任务开发的软件，其著作权的归属与行使应根据项目任务书或合同的约定来确定。若任务书或合同未作明确规定，则软件著作权由接受任务的法人或其他组织享有。
三、法律依据
- 《中华人民共和国著作权法》第十七条规定，受委托创作的作品，著作权的归属由委托人和受托人通过合同约定。合同未作明确约定或者没有订立合同的，著作权属于受托人。
- 《计算机软件保护条例》第九条、第十条、第十一条、第十二条和第十三条分别对不同情形下的软件著作权归属进行了具体规定。
四、实际应用中的建议
明确合同约定：
- 在软件开发前，建议相关当事人（如开发者、委托人、合作开发者等）通过书面合同明确约定软件著作权的归属、使用权限、收益分配等关键条款，以避免潜在的著作权纠纷。
加强知识产权保护意识：
- 开发者应增强知识产权保护意识，及时申请软件著作权登记，以获得法律的保护和认可。同时，也要尊重他人的知识产权，避免侵犯他人的合法权益。
综上所述，定制开发的软件著作权归属问题需要根据具体情况和相关法律规定进行综合判断。在实际操作中，建议各方当事人充分沟通、明确约定，并依法履行相关手续，以确保自身的合法权益得到有效保障。如果您有进一步的疑问或需要具体的法律帮助，请随时向我咨询。