在解答关于“自留地台账和协议哪个有效”的问题时，我们首先要明确的是，自留地台账和协议都是关于土地权益的记录或证明，但它们的法律效力和适用场景可能有所不同。
自留地台账： 自留地台账通常是农村集体经济组织或相关部门对农户自留地的一种记录方式，它可能包含了土地的面积、位置、使用情况等信息。然而，台账本身并不直接产生物权效力，它更多是一种管理或记录工具。在土地权属争议中，台账可以作为辅助证据，但通常不能单独作为确定土地权属的依据。
协议： 协议，特别是经过双方自愿、平等协商并签订的土地使用或转让协议，在法律上通常具有更强的效力。如果协议内容合法、明确，且双方均已履行或愿意履行协议中的义务，那么这份协议就可以作为确定土地权属或使用权益的重要依据。在土地权属争议中，如果双方有明确的协议，且协议内容不违反法律法规的强制性规定，那么协议往往会被优先考虑。
法律效力比较：
物权效力：根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，不动产物权的设立、变更、转让和消灭，经依法登记，发生效力。因此，如果协议涉及土地物权的变更或转让，且已经依法进行了登记，那么这份协议就具有物权效力。而台账本身并不具备物权登记的效力。
证据效力：在土地权属争议中，台账和协议都可以作为证据使用。但协议作为双方自愿达成的合意，其证据效力通常更强。特别是当协议内容明确、合法，且双方均无异议时，协议往往会被作为确定土地权属的主要依据。
适用场景：台账更多用于日常管理和记录，而协议则更多用于明确双方的权利和义务，特别是在土地使用、转让等涉及物权变动的场景中。
结论与建议：
综上所述，自留地台账和协议在法律效力上有所不同，协议通常具有更强的物权效力和证据效力。在处理土地权属争议时，应优先考虑双方签订的合法、明确的协议。