结论前置：协商辞退后，劳动者在特定情况下仍然可以申请劳动仲裁。具体能否申请仲裁，需结合协商辞退的具体情况、协议内容以及相关法律法规来判断。以下从多个角度详细分析：
一、可以申请仲裁的情形
用人单位存在欺诈、胁迫或乘人之危
- 法律依据：根据《中华人民共和国劳动合同法》第二十六条，以欺诈、胁迫的手段或者乘人之危，使对方在违背真实意思的情况下订立或者变更劳动合同的，该劳动合同无效或部分无效。
- 实例说明：若用人单位在协商辞退时，故意隐瞒关键信息（如即将发放的奖金、未支付的加班费等），或者以不支付工资、不办理离职手续等为要挟，迫使劳动者接受不合理的辞退条件，劳动者可以主张协议无效，并申请仲裁要求恢复劳动关系或获得相应的经济补偿。
协商解除协议未履行或未完全履行
- 法律依据：若协商解除劳动合同的协议中明确约定了用人单位应支付的经济补偿金、未结清的工资等，但用人单位未按约定履行，劳动者可以依据协议申请仲裁，要求用人单位履行支付义务。
- 实例说明：双方约定用人单位需支付一个月工资作为经济补偿金，并结清所有未支付的工资，但用人单位仅支付了工资，拒绝支付经济补偿金，劳动者可以申请仲裁要求支付经济补偿金。
协议内容显失公平或违反法律法规
- 法律依据：若协商解除劳动合同的协议内容明显对劳动者不利，如经济补偿金远低于法定标准，或者协议中排除了劳动者的法定权利（如社会保险、福利待遇等），劳动者可以申请仲裁要求调整协议内容或确认协议无效。
- 实例说明：按照法律规定，劳动者应获得三个月工资的经济补偿金，但协议中仅约定支付一个月工资，且未提及社会保险的缴纳问题，劳动者可以申请仲裁要求补足经济补偿金差额，并确认协议中关于社会保险的部分无效。
涉及未明确协商的劳动争议事项
- 法律依据：劳动争议受案范围包括因劳动合同订立、履行、变更、解除等发生的争议，以及因劳动报酬、工伤医疗费、经济补偿或者赔偿金等发生的争议。
- 实例说明：若协商解除劳动合同时，双方未就加班工资、年终奖等事项进行协商，劳动者离职后可以就这些未协商的事项单独申请仲裁，要求用人单位支付相应的报酬。
二、通常不能申请仲裁的情形
- 协议合法有效且已履行完毕：若协商解除劳动合同是双方真实意思表示，过程合法合规，且协议已明确权利义务并履行完毕，劳动者通常不得再就同一事项申请仲裁。例如，双方平等自愿协商解除劳动合同，用人单位按约支付了经济补偿金，劳动者办理了离职手续，并签署了无其他争议的声明，此时劳动者再申请额外补偿一般不会被支持。
三、申请仲裁的注意事项
时效限制：根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》，仲裁申请需自劳动争议发生之日起一年内提出，逾期可能因超过时效而不予受理。因此，劳动者应在知道或应当知道自己的权益受到侵害之日起一年内提起仲裁申请。
证据收集：申请仲裁时，劳动者需提供充分的证据来支持自己的主张。这些证据可以包括劳动合同、辞退通知、工资发放记录、协商解除劳动合同的协议、录音、聊天记录等。证据的充分性和真实性对于仲裁结果具有重要影响。
选择正确的仲裁机构：劳动者应向劳动合同履行地或用人单位所在地的劳动争议仲裁委员会申请仲裁。选择正确的仲裁机构可以确保仲裁程序的顺利进行和仲裁结果的有效性。
总结与建议：协商辞退后能否申请仲裁，取决于协商辞退的具体情况、协议内容以及相关法律法规的规定。在面临此类问题时，劳动者应仔细审查协商解除劳动合同的协议内容，了解自己的权益和义务。如有任何疑问或争议，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供详细的法律建议和帮助。