使用未授权的保藏菌种，确实可能构成侵权，具体是否侵权需结合实际情况判断。以下从不同角度为你详细分析：
一、从知识产权角度分析
专利权：
- 如果该保藏菌种已经被他人申请了专利，并且专利处于有效期内，那么未经专利权人许可，使用该菌种就可能构成专利侵权。根据《中华人民共和国专利法》的相关规定，专利权人对其发明创造享有独占的实施权，未经许可，他人不得为生产经营目的制造、使用、许诺销售、销售、进口其专利产品，或者使用其专利方法以及使用、许诺销售、销售、进口依照该专利方法直接获得的产品。
商业秘密：
- 如果该保藏菌种构成商业秘密（如菌种的特定培养方法、菌种特性等未公开的信息），那么未经权利人许可，获取、使用或者披露该商业秘密就可能构成商业秘密侵权。根据《中华人民共和国反不正当竞争法》的相关规定，商业秘密是指不为公众所知悉、具有商业价值并经权利人采取相应保密措施的技术信息、经营信息等商业信息。
二、从合同角度分析
- 如果在使用菌种前，你与菌种提供方签订了相关合同，合同中明确规定了菌种的使用范围、方式、期限等，而你违反了这些约定，那么就可能构成合同违约。此时，虽然不一定直接涉及侵权，但你需要承担违约责任，如支付违约金、赔偿损失等。
三、从行政许可角度分析
- 某些特殊的菌种可能受到行政许可的限制，即需要获得相关部门的批准才能使用。如果你未经批准就使用了这些菌种，那么可能面临行政处罚，如罚款、没收违法所得等。虽然这不一定直接构成民事侵权，但也是你需要考虑的法律风险。
四、法律建议
- 核实菌种来源：在使用菌种前，务必核实菌种的来源是否合法，是否获得了相关权利人的授权。
- 签订书面合同：如果可能的话，与菌种提供方签订书面合同，明确双方的权利和义务，以避免潜在的纠纷。
- 遵守法律法规：在使用菌种时，务必遵守相关的法律法规和行政许可要求，确保自己的行为合法合规。
若你正在面临使用未授权保藏菌种的相关问题，或者对此有任何疑问，可以直接向我咨询。我将结合你的具体情况，为你提供更详细的法律建议。