发出监理通知单的情形主要包括工程质量、工程安全、工程进度以及其他方面存在的问题，具体如下：
一、工程质量方面
施工与设计不符：当施工单位未按照设计图纸、设计变更等要求进行施工时，例如基础钢筋间距不符合设计规定，监理工程师应立即签发监理通知单，要求施工单位进行整改，直至符合设计要求。
违反建设标准：若施工单位违反国家、行业或地方的建设标准，如混凝土浇筑振捣不达标，监理工程师需责令施工单位按照标准进行整改，并对已经浇筑的部分进行检测和处理。
验收不合格：在分项、分部或隐蔽工程验收时，如果质量不达标，如墙体平整度超差，监理工程师应签发监理通知单，通知施工单位进行修整，直至达到验收标准。
材料设备问题：如果施工单位使用了未经检验或不合格的建筑材料、构配件和设备，如钢材性能不符合要求，监理工程师应立即签发监理通知单，要求施工单位停止使用，并将不合格材料清退出场，同时检查处理已经使用的部位。
二、工程安全方面
安全管理缺陷：如果施工单位的安全管理制度不完善或执行不力，如缺乏安全教育培训，监理工程师应签发监理通知单，要求施工单位完善制度，并加强安全教育培训。
安全防护不足：当现场安全防护设施缺失或不达标时，如高处作业未佩戴安全带，监理工程师应立即签发监理通知单，要求施工单位补充完善安全防护设施。
安全隐患：如果存在漏电、机械设备未维护等安全隐患，监理工程师应签发监理通知单，要求施工单位限期整改，消除安全隐患。
三、工程进度方面
进度滞后：当实际进度落后于计划进度，且施工单位没有提出合理的调整措施时，如基础工程延期，监理工程师应签发监理通知单，要求施工单位分析原因，并制定赶工计划。
关键线路受阻：如果关键线路的进度受到影响，如路基处理不当导致延误，监理工程师应签发监理通知单，要求施工单位采取措施加快进度，确保关键线路不受影响。
四、其他方面
人员资质不符：如果关键岗位的人员资质不达标，如项目经理无执业资格，监理工程师应签发监理通知单，要求施工单位更换合格的人员。
不配合监理：如果施工单位拒绝接受监理的检查或指令，如不配合隐蔽工程检查，监理工程师应签发监理通知单，要求施工单位端正态度，积极配合监理工作。
其他违规行为：包括施工单位未按专项施工方案施工，或在造价等方面存在违法违规行为，监理工程师也应根据具体情况签发监理通知单，要求施工单位进行整改。
在签发监理通知单时，监理工程师还需注意以下几点：
监理通知单是工程监理中的重要工具，其有效签发与跟踪对于保障工程质量、安全、进度及合规性至关重要。如果您在工程监理过程中遇到任何问题，都可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供专业的法律建议。