卫生院的人事代理是否会被清退，不能一概而论，需根据具体情况分析。以下从不同角度进行详细阐述：

一、人事代理的性质与目的

人事代理是一种人事管理制度，旨在通过专业机构或单位代理管理人事关系，包括档案保管、社保缴纳、职称评定等事务。其目的在于提高人事管理的效率和专业性，减轻用人单位的负担。卫生院作为事业单位，采用人事代理制度，通常是为了更好地管理其员工的人事关系。

二、清退人事代理的法律依据与情形

1. 合同到期或解除：如果卫生院与人事代理机构或员工之间的合同到期，且双方未续签，或者合同因某种原因被解除，那么人事代理关系自然终止。但这并不意味着员工一定会被清退，因为卫生院可能选择与其他机构或员工重新签订合同。
2. 政策调整或改革：随着国家政策的调整或事业单位改革的深入，卫生院的人事管理制度可能发生变化。如果政策或改革要求卫生院取消人事代理制度，那么人事代理可能会被清退。但这种情况通常会有相应的过渡期和安置措施。
3. 员工表现或需求变化：如果员工在人事代理期间表现不佳，或者卫生院对员工的需求发生变化（如岗位调整、编制缩减等），卫生院可能会考虑清退人事代理。但这种情况需要依据相关法律法规和合同约定进行，不能随意清退。

三、清退人事代理的法律程序与保障

1. 法律程序：如果卫生院决定清退人事代理，必须遵循相关的法律程序。这包括提前通知员工或人事代理机构、协商解除合同、支付经济补偿等。如果违反法律程序，卫生院可能面临法律责任。
2. 员工权益保障：在清退人事代理的过程中，必须保障员工的合法权益。这包括支付应得的工资、奖金、福利等，以及办理社保转移、档案保管等手续。如果员工的权益受到侵害，可以通过法律途径维护自己的权益。

四、建议与措施

1. 了解合同与政策：作为卫生院的人事代理员工或相关机构，应仔细了解与卫生院签订的合同以及相关政策规定。这有助于明确双方的权利和义务，以及在清退情况下应享有的权益。
2. 积极沟通协商：如果面临清退风险，应积极与卫生院进行沟通协商。通过协商，可以寻求双方都能接受的解决方案，如续签合同、调整岗位、支付经济补偿等。
3. 寻求法律援助：如果认为自己的权益受到侵害，或者与卫生院在清退问题上存在争议，可以寻求法律援助。作为专业律师，我可以提供相关的法律咨询和代理服务，帮助维护你的合法权益。