医院人事代理是否会被清退，不能一概而论，需结合具体情况分析。以下从不同角度进行详细阐述：
一、人事代理的基本性质与法律地位
人事代理是一种人事管理制度，通常指由政府人事部门所属的人才服务中心，按照国家有关人事政策法规要求，接受单位或个人委托，在其服务项目范围内，为多种所有制经济尤其是非公有制经济单位及各类人才提供人事档案管理、职称评定、社会养老保险金收缴、出国政审等全方位服务，是实现人员使用与人事关系管理分离的一项人事改革新举措。从法律地位上看，人事代理人员与医院之间并非直接的劳动关系，而是通过人才服务中心等中介机构建立的一种特殊的人事关系。
二、清退人事代理的可能情形
合同到期或协商一致解除：如果人事代理合同到期，且双方未就续签达成一致，或者双方协商一致解除合同，那么人事代理人员可能会被清退。这种情况下，清退是合法的，且通常不会引发法律纠纷。
医院政策调整或业务需求变化：医院可能因政策调整、业务需求变化等原因，需要减少或调整人事代理岗位。这种情况下，医院需按照相关法律法规和合同约定，与人事代理人员协商解除合同或进行岗位调整。如果医院未能依法进行，则可能面临法律风险。
人事代理人员违规或不胜任工作：如果人事代理人员存在严重违反医院规章制度、不胜任工作等情形，医院有权依据相关法律法规和合同约定，解除与人事代理人员的合同。这种情况下，清退也是合法的。
三、人事代理人员权益保障
合同权益：人事代理人员应仔细阅读并理解与医院及人才服务中心签订的合同条款，确保自己的权益得到充分保障。在合同履行过程中，如遇到问题或争议，应及时与医院或人才服务中心沟通协商。
劳动权益：尽管人事代理人员与医院之间并非直接的劳动关系，但他们仍享有劳动法规定的部分权益，如获得劳动报酬、享受社会保险等。如果医院未能依法保障这些权益，人事代理人员可以向相关部门投诉或寻求法律援助。
争议解决：如果人事代理人员与医院之间发生争议，应首先尝试通过协商、调解等方式解决。如果无法达成一致，可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁或向人民法院提起诉讼。
四、建议与注意事项
了解政策与合同：人事代理人员应密切关注医院政策变化和合同条款，确保自己了解并遵守相关规定。
保留证据：在合同履行过程中，人事代理人员应妥善保管与工作相关的证据材料，如工资单、工作记录、考勤记录等，以备不时之需。
及时咨询：如果遇到法律问题或争议，人事代理人员应及时向我咨询，以便获得专业的法律建议和帮助。
综上所述，医院人事代理是否会被清退取决于多种因素，包括合同约定、医院政策、业务需求以及人事代理人员自身的表现等。因此，无法简单地给出一个肯定的或否定的答案。如果您是人事代理人员，且担心自己的权益受到侵害，建议密切关注相关政策变化，及时与医院沟通协商，并在必要时寻求法律援助。