结论：工伤不予认定后，若劳动者选择自费治疗，其认定标准主要围绕是否构成工伤的实质要件进行，而赔偿方法则需根据具体情况，包括是否最终被认定为工伤、用人单位的态度及保险情况等来确定。以下是对这两个问题的详细解答：
一、工伤不予认定后自费的认定标准
工伤的实质要件：
- 工伤的认定通常基于“三工”原则，即工作时间、工作场所、因工作原因。若劳动者在工作时间和工作场所内，因工作原因受到事故伤害，或从事与工作有关的预备性或者收尾性工作受到事故伤害，以及因履行工作职责受到暴力等意外伤害等，均应认定为工伤。
- 即使初次工伤认定被驳回，劳动者仍可基于上述实质要件，通过行政复议或行政诉讼等途径争取工伤认定。在此过程中，自费治疗的费用是否应被认定为工伤相关费用，关键在于是否最终能证明该伤害构成工伤。
自费治疗的合理性：
- 劳动者在工伤认定未决期间选择自费治疗，应确保治疗行为的合理性和必要性。这包括选择正规的医疗机构、接受符合医疗常规的治疗等。
- 若自费治疗行为被后续认定为与工伤无关，或存在过度治疗、不必要的治疗等情况，则相关费用可能无法获得赔偿。
二、工伤不予认定后自费的赔偿方法
若最终被认定为工伤：
- 用人单位已参保：根据《工伤保险条例》的规定，劳动者应享受的工伤保险待遇，包括医疗费、康复费、住院伙食补助费等，均由工伤保险基金支付。此时，劳动者自费支付的费用，可凭相关票据向工伤保险基金申请报销。
- 用人单位未参保：若用人单位未依法为劳动者缴纳工伤保险费，则根据《工伤保险条例》第六十二条的规定，由用人单位按照工伤保险待遇项目和标准支付费用。劳动者自费支付的费用，可向用人单位主张赔偿。
若最终未被认定为工伤：
- 民事侵权赔偿：若劳动者能证明伤害是由第三人造成的，且该第三人存在过错，则可根据《民法典》的相关规定，向第三人主张民事侵权赔偿。此时，自费治疗费用可作为损失的一部分，向第三人索赔。
- 用人单位无过错时的补偿：在极少数情况下，即使伤害未被认定为工伤，且不存在第三人侵权，若用人单位对伤害的发生存在一定过错（如未提供安全的工作环境等），劳动者也可基于公平原则或用人单位的过错程度，要求用人单位给予一定的经济补偿。但这种情况下的补偿标准通常较低，且需具体案件具体分析。
建议：
- 在工伤认定未决期间，劳动者应尽量保留好所有与治疗相关的票据和证据，以便后续主张权利。
- 若对工伤认定结果有异议，应及时通过行政复议或行政诉讼等途径寻求救济。
- 在处理自费治疗费用的赔偿问题时，建议咨询专业律师，以便更准确地评估案件情况和制定维权策略。
如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供详细的法律建议。