公安机关仅凭被害人陈述及不完整的微信聊天记录立案，从法律程序上讲，并不直接构成违法，但这样的证据组合可能不足以充分支持立案的合理性，具体需结合案件实际情况和证据链完整性来判断。以下从几个角度详细分析：

1. 立案的法律依据与标准：

   • 根据《中华人民共和国刑事诉讼法》的相关规定，公安机关在接到报案、控告、举报或自首材料后，认为有犯罪事实需要追究刑事责任，且属于自己管辖的，应当立案。这里的“有犯罪事实需要追究刑事责任”是立案的基本条件，它并不要求证据必须达到充分、确凿的程度，而是要求有一定的证据表明犯罪事实可能存在。
   • 被害人陈述和微信聊天记录，作为两种不同类型的证据，都可以在一定程度上证明犯罪事实的存在。被害人陈述是直接证据，能够直接描述犯罪行为的发生过程；微信聊天记录则可能包含犯罪行为的间接证据，如犯罪计划的讨论、犯罪后的交流等。

2. 证据的完整性与充分性：

   • 然而，仅凭被害人陈述和不完整的微信聊天记录，可能难以形成完整的证据链。在刑事诉讼中，证据的完整性和充分性是至关重要的。一个完整的证据链应该能够无遗漏地证明犯罪行为的每一个环节，包括犯罪动机、犯罪准备、犯罪实施、犯罪结果等。
   • 如果微信聊天记录不完整，或者无法与其他证据相互印证，那么其证明力就会大打折扣。同样，如果被害人陈述缺乏其他证据的支持，也可能被视为孤证，难以单独作为定案的依据。

3. 立案后的证据收集与审查：

   • 即使公安机关基于被害人陈述和不完整的微信聊天记录立案，这并不意味着案件就此定型。在立案后，公安机关还有义务继续收集、审查证据，以完善证据链，确保案件的公正处理。
   • 如果在后续的调查中，公安机关发现证据不足或者存在矛盾，他们有权撤销案件或者作出其他相应的处理。因此，立案并不等同于定罪，它只是刑事诉讼程序的一个开始。

4. 对当事人的建议：

   • 对于被害人而言，如果仅凭自己的陈述和不完整的微信聊天记录就希望公安机关立案，建议尽可能提供其他相关证据，如现场照片、视频、证人证言等，以增强证据的充分性和完整性。
   • 对于犯罪嫌疑人而言，如果面临仅凭被害人陈述和不完整的微信聊天记录就被立案的情况，不要惊慌失措。在立案后，你有权委托律师进行辩护，律师会帮助你分析证据、提出辩护意见，并维护你的合法权益。

总结来说，公安机关仅凭被害人陈述及不完整的微信聊天记录立案，并不直接违反法律程序，但这样的证据组合可能不足以充分支持立案的合理性。在刑事诉讼中，证据的完整性和充分性是至关重要的。如果你或你身边的人遇到类似情况，可以直接向我咨询，我会根据具体情况提供专业的法律建议。