在诈骗案件立案后，若诈骗犯退还了钱款，其处理方式是一个涉及多个法律阶段和部门的严谨流程。以下是对此问题的详细解答：

一、总体处理原则

1. 扣押与保管：公安机关在接收到诈骗犯退还的款项后，会立即进行扣押，并确保资金的安全性和可追溯性。他们会制作详细的财物清单，记录款项的来源、金额、扣押时间等关键信息，并开具正式的收据。

2. 权属确认：对于能够明确认定为被害人合法财产且权属清晰的款项，公安机关会及时返还给被害人。若权属存在争议或不明确，则需等待法院审理后确定。

二、具体处理流程

1. 侦查阶段：

   • 公安机关会积极调查取证，核实被害人的具体情况，包括被骗金额、身份信息等，为后续返还财物做好充分准备。
   • 若诈骗犯在此阶段主动退赃，公安机关会记录并查收退赃情况，妥善保管财物。

2. 审查起诉阶段：

   • 人民检察院在审查案件时，会要求公安机关将扣押的款项随案移送至检察院指定的账户进行保管，并确保资金流转的完整记录。
   • 检察院会进一步核实被害人的情况，确保信息的准确性和完整性，并在量刑建议中考虑犯罪嫌疑人的退赃情节。

3. 审判阶段：

   • 法院在审理诈骗案件时，会根据查明的事实和证据，确定被害人的名单和被骗金额，并制定详细的返还方案。
   • 若多个被害人对同一笔款项主张权利，法院会依法按比例进行分配。
   • 判决生效后，法院会依据返还方案及时将款项返还给被害人，通常通过银行转账等正规财务流程进行，并留存转账凭证。

4. 特殊情况处理：

   • 对于权属明确的合法财产，且返还不损害其他被害人或利害关系人利益、不影响诉讼正常进行的，可及时返还给被害人。
   • 诈骗犯退还款项所产生的孳息（如利息）一般会随本金一并返还给被害人。
   • 若无法找到被害人或被害人身份无法确定，所退款项由司法机关妥善保管。待被害人身份确定或找到后，再按法定程序返还；若长时间无人认领，则可能上缴国库。

5. 违法所得处理：

   • 对于被认定为被害人的违法所得的款项，法院会依法予以追缴或者责令退赔。

三、被害人的配合与建议

1. 积极配合司法机关：被害人应尽快报案，向警方详细说明情况并提供线索。在后续的处理过程中，积极配合公安机关、检察院和法院的工作，提供必要的证据和信息。

2. 保留好相关证据：如聊天记录、转账记录、合同协议等，这些证据对追赃工作至关重要，有助于司法机关更准确地查明事实，确定被骗金额和被害人身份。

3. 寻求专业法律帮助：若您对处理流程或法律条款有疑问，建议咨询专业律师或法律机构，以获取更准确的法律意见和帮助。

综上所述，诈骗案件立案后诈骗犯退还的钱款处理需严格遵循法律程序和规定，确保资金的合法、公正分配。被害人应积极配合司法机关的工作，并保留好相关证据，以便尽快解决纠纷并挽回损失。