关于协议楼房拆迁时的赔偿问题，这是一个涉及多个方面的复杂议题，但我会尽量为您梳理清晰，确保您能够全面理解。
首先，拆迁赔偿主要涵盖以下几个方面：
一、房屋价值补偿
这是拆迁赔偿中最核心的部分。房屋的价值补偿是根据被拆迁房屋的区位、用途、建筑面积、建筑结构及成新率等因素，通过具有资质的房地产价格评估机构进行评估确定的。评估过程会充分考虑房屋的市场价值，确保补偿金额能够合理反映房屋的实际价值。如果您选择货币补偿，那么拆迁方将按照评估价一次性支付给您现金；如果您选择产权调换，即“拆一还一”，那么拆迁方将提供与被拆迁房屋在区位、面积、用途等方面相当的房屋进行调换，并根据置换房屋的价值差异进行差价结算。
二、搬迁与临时安置补偿
搬迁补偿用于弥补您因搬迁而产生的费用，包括搬运家具、设备的费用及临时存放物品的费用等。具体标准会根据当地市场行情和实际搬迁情况来确定。此外，如果拆迁导致您无法立即入住新房，拆迁方还需要提供临时安置方案，如周转房，或者按月发放临时安置补助费，直至您能够入住安置房。
三、停产停业损失补偿（针对非住宅房屋）
如果您的房屋是用于经营的非住宅房屋，如商铺、工厂等，那么因拆迁导致的停产停业损失也将得到补偿。补偿金额会根据房屋被征收前的效益、停产停业期限等因素来确定，通常通过评估机构评估企业经营收入、利润及员工工资等因素来计算。
四、其他补助和奖励
除了上述基本补偿外，地方政府还可能根据实际情况给予您额外的补助，如困难补助、搬迁补助等。同时，为了鼓励您积极配合拆迁工作，拆迁方还可能设置拆迁奖励，如在规定时间内签订拆迁协议并完成搬迁的，您将获得一定金额的奖励。
在签订拆迁协议时，您需要注意以下几点：
仔细了解当地政策：具体的补偿标准和方式可能因地区而异，甚至在同一地区的不同项目中也可能有所不同。因此，在签订协议前，您一定要仔细了解当地的法律法规和政策规定。
与拆迁方充分沟通：在签订协议前，您应与拆迁方就补偿方案进行充分沟通，确保自己的权益得到充分保障。如果您对补偿方案有异议，可以提出并协商解决。
保留好相关证据：在拆迁过程中，您应保留好与房屋价值、搬迁费用等相关的证据，以便在需要时进行维权。
寻求法律帮助：如果您对拆迁协议或补偿方案有疑问或不满，可以咨询专业律师或相关机构，寻求法律帮助以维护自己的合法权益。
希望以上解答能够帮助您全面理解协议楼房拆迁时的赔偿问题。如果您还有其他疑问或需要进一步的帮助，请随时告诉我。