结论：员工入职6个月没有签劳动合同后来签了，过两年后离职，仍然有权提起劳动仲裁来维护自己的合法权益，但具体可主张的权益和仲裁时效需结合实际情况来判断。

详细分析：

1. 未签劳动合同期间的法律后果：

   • 根据《劳动合同法》的规定，用人单位自用工之日起超过一个月不满一年未与劳动者订立书面劳动合同的，应当向劳动者每月支付二倍的工资。这是法律对用人单位未履行签订劳动合同义务的一种惩罚性规定。
   • 在您的情况下，入职前6个月未签劳动合同，因此，对于这6个月中的前5个月（因为第一个月不计算双倍工资），您有权主张双倍工资。但需要注意的是，主张双倍工资的仲裁时效为一年，从用人单位不签订书面劳动合同的违法行为结束之次日开始计算。所以，对于这5个月的双倍工资，如果距离您离职已经超过一年，则可能因超过仲裁时效而无法主张。不过，具体还需结合您离职的时间和当地仲裁实践来判断。

2. 后来签订劳动合同后的法律关系：

   • 后来您与用人单位签订了劳动合同，这形成了书面的劳动关系证明。但这并不影响您之前未签劳动合同期间应享有的权益。
   • 劳动合同的签订，只是对双方劳动关系的一种确认和规范，并不改变之前未签合同的事实和法律后果。

3. 离职后仍可主张的权益：

   • 确认无固定期限劳动合同关系：如果后来签订的劳动合同是固定期限的，且您在用人单位连续工作满十年，或者连续订立二次固定期限劳动合同且没有法定解除情形的，您有权要求签订无固定期限劳动合同。即使已经离职，您仍可以基于这一事实主张相关权益（如经济补偿等，具体需看离职原因）。
   • 其他因未签合同导致的权益受损：如果因为未签合同导致其他权益受损，如应得的劳动报酬、福利待遇等方面存在争议，您也可以在仲裁中一并提出，并要求用人单位承担相应的赔偿责任。

4. 仲裁申请的准备与提交：

   • 在申请仲裁前，您需要明确自己的仲裁请求，即希望主张哪些权益。这可以是要求支付未签合同的二倍工资（在仲裁时效内）、确认无固定期限劳动合同关系、支付经济补偿或其他与劳动关系相关的争议。
   • 您还需要准备充分的证据来证明与用人单位之间的劳动关系以及自己的主张。这些证据可以包括工作证、考勤记录、银行流水、后来签订的劳动合同、同事证言等能证明您在该单位工作的材料。
   • 准备好相关材料和明确仲裁请求后，您可以向当地的劳动争议仲裁委员会提交仲裁申请。委员会将依法进行审理，并根据事实和法律作出公正的裁决。

建议：

• 鉴于仲裁时效的限制，建议您尽快咨询并准备相关材料，以便在仲裁时效内提出自己的主张。
• 在申请仲裁前，您可以先尝试与用人单位进行协商，看是否能达成和解协议，以节省时间和精力。
• 如果对仲裁结果不满意，您还可以在收到仲裁裁决书之日起十五日内向人民法院提起诉讼。

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