结论：合同寄回甲方但钱未退回的情况下，留复印件在多数情况下是具有一定的法律效果的，但具体效果还需根据复印件的内容、形式以及实际使用场景等因素综合判断。以下从多个角度进行详细分析：
复印件的法律效力基础：
- 根据一般的法律原则，复印件本身并不具备与原件同等的法律效力，因为它容易被篡改或伪造。然而，在合同纠纷中，如果复印件能够与其他证据相互印证，形成完整的证据链，那么它仍然可能被法院采纳作为认定事实的依据。
- 特别是当原件无法获取或丢失时，复印件在证明合同关系、交易内容等方面可能发挥重要作用。
复印件在合同纠纷中的具体应用：
- 证明合同关系：如果复印件能够清晰展示合同的主要条款和双方当事人的签字或盖章，那么它可以在一定程度上证明合同关系的存在。
- 辅助证明交易内容：在涉及金钱交易的合同中，复印件可以辅助证明交易的具体内容，如金额、支付方式等。但需要注意的是，仅凭复印件可能难以直接证明款项的实际支付情况。
- 与其他证据结合使用：复印件通常需要与其他证据（如银行转账记录、聊天记录、证人证言等）结合使用，以增强其证明力。
针对您具体情况的建议：
- 保留所有相关证据：除了合同复印件外，还应保留与合同履行相关的所有证据，如邮件、短信、银行转账记录等。这些证据将有助于您在后续的法律程序中证明自己的权益。
- 及时与甲方沟通：在寄回合同后，应及时与甲方沟通确认款项的退回情况。如果甲方拖延或拒绝退回款项，您可以考虑通过法律途径维护自己的权益。
- 咨询专业律师：虽然我可以为您提供一般的法律建议，但每个具体案件都有其独特性和复杂性。因此，在涉及合同纠纷时，建议您咨询专业律师以获取更具体、更针对性的法律帮助。
可能的法律后果：
- 如果甲方在收到合同后未按照约定退回款项，您有权要求甲方履行合同义务或承担违约责任。这可能包括要求甲方支付款项、赔偿损失等。
- 如果双方无法协商解决纠纷，您可以通过诉讼或仲裁等法律途径来维护自己的权益。在此过程中，合同复印件和其他相关证据将发挥重要作用。
总结与进一步思考：在合同纠纷中，复印件虽然不如原件具有直接的证明力，但在与其他证据相互印证的情况下，仍然可能被法院采纳作为认定事实的依据。因此，在寄回合同后保留复印件是一个明智的选择。同时，您还应积极采取其他措施来维护自己的权益，如及时与甲方沟通、咨询专业律师等。如果您在后续过程中遇到任何法律问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。