针对实际经营人因假冒伪劣被批捕后其欠款如何处理的问题，核心结论需分情况讨论，具体如下：

1. 刑事程序优先原则
   实际经营人因生产、销售假冒伪劣产品被批捕，说明案件已进入刑事诉讼阶段。根据《刑事诉讼法》第101条，被害人有权提起刑事附带民事诉讼要求赔偿。若您是欠款方（如被拖欠货款、工程款等），需在刑事案件审理过程中同步主张民事权利，否则可能因刑事判决优先执行而影响债权实现。

2. 欠款性质影响处理方式

   • 合法债务：若欠款基于真实交易（如采购原料、支付工资等），即使经营人被批捕，债务仍受法律保护。您可向法院申请财产保全，查封其名下资产（如房产、车辆、银行账户等），确保后续执行有财产可供分配。
     
   • 非法债务：若欠款与假冒伪劣行为直接相关（如支付“保护费”、行贿等），则该债务不受法律保护，您无法通过法律途径追讨，甚至可能因参与违法行为面临法律风险。

3. 公司责任与个人责任区分

   • 若经营人以公司名义经营：根据《公司法》，公司债务原则上由公司财产承担。但若存在“法人人格否认”情形（如财产混同、过度支配等），您可主张实际经营人与公司承担连带责任。
     
   • 若经营人以个人名义经营：债务直接由其个人财产承担，但需注意其配偶或家庭成员是否涉及共同债务（如用于家庭共同生活）。

4. 执行阶段的关键操作
   即使刑事案件未结案，您仍可单独提起民事诉讼或申请仲裁（如合同有约定）。若刑事判决涉及罚金或没收财产，根据《刑法》第60条，您的合法债权优先于罚金受偿，但需在执行阶段主动向法院申报债权。

行动建议：

1. 立即收集所有交易凭证（合同、发票、送货单等），证明欠款合法性；
   
2. 向公安机关或检察院申请查阅案卷，了解涉案财产查封情况；
   
3. 委托律师向法院提起民事诉讼或刑事附带民事诉讼，同步申请财产保全；
   
4. 关注刑事案件进展，若经营人被判刑，及时向执行法院申报债权。
   

如有进一步细节（如欠款金额、交易模式、公司结构等），可向我补充说明，我会为您制定更具体的方案。