关于“全部结清违约金是否合法”的问题，结论是：这取决于具体合同条款的约定以及相关法律法规的规定，不能一概而论。 下面我将从几个角度详细分析这个问题：

1. 合同条款的约定：

   • 违约金是合同双方当事人在合同中约定的，当一方不履行合同义务或者履行合同义务不符合约定时，应向对方支付的一定数额的金钱。因此，如果合同中明确约定了“全部结清违约金”的条款，并且该条款不违反法律法规的强制性规定，那么该条款就是合法的，双方当事人应当遵守。
   • 然而，如果合同中的违约金条款存在显失公平、欺诈、胁迫等情形，或者违约金数额过高，超出了实际损失的合理范围，那么该条款可能会被认定为无效或可撤销。

2. 相关法律法规的规定：

   • 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，当事人可以约定一方违约时应当根据违约情况向对方支付一定数额的违约金，也可以约定因违约产生的损失赔偿额的计算方法。但是，约定的违约金过分高于造成的损失的，人民法院或者仲裁机构可以根据当事人的请求予以适当减少。
   • 这意味着，即使合同中约定了“全部结清违约金”，如果该违约金数额过高，超出了实际损失的合理范围，法院或仲裁机构也有权根据当事人的请求进行适当调整。

3. 实际案例与司法实践：

   • 在司法实践中，法院或仲裁机构在审理涉及违约金的案件时，会综合考虑合同履行情况、当事人过错程度、预期利益等因素，根据公平原则和诚实信用原则予以衡量，并作出裁决。
   • 因此，即使合同中约定了“全部结清违约金”，也不意味着违约方必须无条件支付全部违约金。如果违约方能够证明违约金数额过高，超出了实际损失的合理范围，那么法院或仲裁机构可能会支持其减少违约金的请求。

建议：

• 在签订合同时，双方当事人应当明确约定违约金的数额或计算方法，并确保该约定不违反法律法规的强制性规定。
• 如果合同中约定了“全部结清违约金”的条款，建议双方当事人在合同中进一步明确违约金的计算依据和合理范围，以避免后续纠纷。
• 如果发生违约情况，违约方应当及时与守约方沟通协商，寻求解决方案。如果无法协商解决，可以寻求法律途径解决争议。

最后，如果你在合同纠纷方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。我会根据你的具体情况，为你提供专业、全面的法律建议。