针对您提出的“指挥违规作业事故怎样处罚”的问题，我将结合相关法律法规和实际操作指南，为您提供一个详细且深入的解答。
首先，我们需要明确的是，指挥违规作业造成事故，其处罚是依据事故的严重程度、造成的后果以及相关法律法规来进行的。这主要包括行政处罚、刑事责任以及其他可能的措施。
一、行政处罚
对生产经营单位的处罚：
- 发生一般事故的，处三十万元以上一百万元以下的罚款；
- 发生较大事故的，处一百万元以上二百万元以下的罚款；
- 发生重大事故的，处二百万元以上一千万元以下的罚款；
- 发生特别重大事故的，处一千万元以上二千万元以下的罚款；若情节特别严重、影响特别恶劣，罚款数额可提升至前款规定的二倍以上五倍以下。
对主要负责人的处罚：
- 发生一般事故的，处上一年年收入百分之四十的罚款；
- 发生较大事故的，处上一年年收入百分之六十的罚款；
- 发生重大事故的，处上一年年收入百分之八十的罚款；
- 发生特别重大事故的，处上一年年收入百分之一百的罚款。
对其他责任人员的处罚：
- 对违章指挥的直接责任人员和其他相关责任人员，根据其在事故中的过错程度，给予相应的行政处分或经济处罚。
二、刑事责任
如果违章指挥行为构成犯罪，如重大责任事故罪等，将依法追究刑事责任。根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，在生产、作业中违反有关安全管理的规定，因而发生重大伤亡事故或者造成其他严重后果的，处三年以下有期徒刑或者拘役；情节特别恶劣的，处三年以上七年以下有期徒刑。
三、其他措施
停产整顿：
- 对于存在严重安全隐患或多次发生安全事故的生产经营单位，监管部门可以责令其停产整顿，直至消除安全隐患。
吊销证照：
- 对于严重违反安全生产法规的生产经营单位，监管部门可以吊销其相关证照，取消其生产经营资格。
四、处理流程与建议
立即制止违章行为：
- 一旦发现违章作业或违章指挥，无论是普通员工还是安全管理人员，都有责任和义务当场指出并要求立即停止违章行为。
及时报告与记录：
- 如果违章行为未得到纠正，员工应及时向本单位的安全生产管理机构或负责人报告，报告内容应包括时间、地点、人物、行为等详细信息。
安全教育与处罚：
- 对违章人员应进行安全教育，使其认识到违章行为的危害性和可能导致的严重后果。
- 根据情节的严重性，可对违章人员采取相应的处罚措施，如警告、罚款、扣绩效、停职检查等。
深入调查与预防措施：
- 安全管理人员应深入调查违章行为的原因，了解是由于员工安全意识淡薄、培训不足，还是管理制度存在漏洞等导致的。
- 根据调查结果，企业应修订和完善相关规章制度，加强员工的安全培训和操作技能提升，并加强整体层面的安全管理工作。
综上所述，指挥违规作业造成事故的处罚是严格且多层次的，旨在通过法律手段确保生产安全，防止类似事故的再次发生。希望这个解答能对您有所帮助，如果您还有其他问题或需要进一步的咨询，请随时告诉我。