结论前置：运政查黑车时，即使车上没有乘客但有收款记录，依然可以立案并进行罚款处罚。

法律背景与依据：

根据《中华人民共和国道路运输条例》第六十三条的规定，未取得道路运输经营许可，擅自从事道路运输经营的行为是违法的。这里的“道路运输经营”包括客运和货运等，而“黑车”通常指的是没有合法营运手续，擅自从事客运的车辆。对于此类违法行为，县级以上地方人民政府交通运输主管部门（或道路运输管理机构）有权进行处罚，处罚措施包括责令停止经营、没收违法所得以及罚款。

具体处罚情况分析：

1. 有违法所得的情况：

   • 如果运政部门通过调查取证（包括收款记录等）确认存在违法所得，那么将没收违法所得，并处以违法所得2倍以上10倍以下的罚款。例如，若违法所得为5000元，则可能面临1万元至5万元的罚款。

2. 无违法所得或违法所得不足2万元的情况：

   • 即使车上没有乘客，但如果运政部门通过其他证据（如收款记录、车辆行驶轨迹、驾驶员陈述等）确认存在非法营运行为，且没有违法所得或违法所得不足2万元，那么将处以3万元以上10万元以下的罚款。

收款记录的作用：

收款记录是运政部门确认非法营运行为的重要证据之一。它证明了驾驶员存在收取费用的行为，即使车上没有乘客，也可能构成非法营运。因为非法营运不仅仅局限于实际载客的行为，还包括以有偿服务为目的的准备行为或意图行为。收款记录可以表明驾驶员有从事非法营运的意图和实际行动。

建议与后续处理：

1. 配合执法：在遭遇运政检查时，应积极配合调查，提供必要的证据和资料，切勿逃避或抵抗执法。
2. 接受处罚：如果确认存在非法营运行为，应接受运政部门的处罚决定，并在规定期限内缴纳罚款。
3. 法律救济：如果对运政部门的处罚决定不服，可以依法申请行政复议或提起行政诉讼来维护自己的合法权益。

总结与提醒：

跑“黑车”是违法行为，不仅可能面临严厉的罚款处罚，还可能构成犯罪并依法追究刑事责任。因此，建议广大驾驶员严格遵守道路运输法规，不要从事非法营运活动。如果已经涉及相关问题，应理性面对并配合相关部门的调查与处理。如有任何法律疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。