单位请假扣款是否合法，需根据请假类型及扣款方式综合判断。以下从不同请假类型及扣款合法性角度进行分析：
一、事假扣款合法性
法律依据：
- 根据劳动法相关规定及《关于贯彻执行〈中华人民共和国劳动法〉若干问题的意见》，职工因个人原因请事假，企业有权不支付其事假期间的工资。这是因为事假属于员工个人原因导致的非正常出勤，企业无需承担该时段的薪酬支付义务。
扣款计算：
- 事假扣款通常按照“月工资÷21.75×请假天数”来计算，其中21.75为劳动法规定的月计薪天数。这一计算方式确保了扣款的合理性及透明度。
- 企业也可根据内部规章制度及劳动合同中的相关条款，合理确定扣减比例或具体金额，但应确保员工的基本工资或当地最低工资标准得到保障。
合法性前提：
- 企业在执行事假扣薪时，应确保扣款行为符合劳动合同的约定，不得无故或过度扣除员工工资，否则将构成违法行为。
- 企业应确保事假扣薪的相关规定经过民主程序制定，并向员工公示告知，以确保其知晓并接受相关规定。
二、病假扣款合法性
法律依据：
- 病假期间，员工享有医疗期的权利，企业应按照相关规定支付病假工资或疾病救济费。
- 病假工资的支付标准通常根据员工的工龄和病假期限来确定，且不得低于当地最低工资标准的80%。
扣款限制：
- 企业不得以病假为由进行恶意克扣工资，如扣薪幅度远超正常日工资水平或未按照规定支付病假工资等，这将构成违法行为。
三、年假扣款合法性
法律依据：
- 根据《职工带薪年休假条例》，用人单位有权根据生产、工作的具体情况，并考虑职工本人意愿，统筹安排职工年休假。
- 在特定情况下，如事假、病假等无薪假期超过一定天数，用人单位可以要求职工使用年休假来抵扣，但需遵循法定程序和条件，如提前通知职工、与职工协商等。
合法性前提：
- 用人单位不得强制职工使用年休假抵扣其他假期，除非符合法律法规规定的情形。
- 用人单位在安排年休假时，应确保职工的合法权益不受侵犯，如不得因职工拒绝使用年休假抵扣其他假期而对其进行处罚或歧视。
四、操作建议与员工维权
企业操作建议：
- 企业应制定明确的请假及扣款制度，并确保制度经过民主程序制定且向员工公示告知。
- 在扣薪前，企业应与员工进行充分沟通，解释扣款原因及计算方式，避免产生误解或纠纷。
员工维权建议：
- 若认为企业扣薪行为不合理或违法，员工首先应与企业进行沟通协商，尝试解决问题。
- 协商不成时，员工可向当地劳动管理部门进行投诉或举报，寻求官方介入处理。
- 必要时，员工可依法向当地人民法院申请支付令或提起诉讼，以维护自身合法权益。在诉讼过程中，员工应提供充分的证据支持自己的主张。
总结来看，单位请假扣款是否合法取决于请假类型及扣款方式。企业在执行请假扣薪时，应严格遵守相关法律法规及劳动合同约定，确保扣款行为的合法性与合理性。同时，员工也应了解自己的权益和维权途径，以便在必要时采取适当的行动来维护自己的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。