保险公司以与4S店有合作关系为由对全损车辆赔付金额打折，这一做法通常是不合理的。以下从不同角度为你详细分析：

从保险合同约定角度

保险合同是保险公司与投保人之间权利义务关系的重要依据。在车辆全损的情况下，赔付金额一般是根据保险合同中约定的计算方式来确定，比如按照车辆的实际价值、保险金额等标准。只要符合合同约定的赔付条件，保险公司就应当按照合同约定的金额进行赔付，而不能随意以与4S店有合作关系这种合同之外的理由来打折。

例如，如果你的保险合同明确规定车辆全损时按照车辆投保时的实际价值进行赔付，且已经对车辆实际价值进行了评估和确定，那么保险公司就应该按照这个确定的金额全额赔付，不能因为和4S店有合作就减少赔付金额。

从公平原则角度

保险活动应当遵循公平原则。投保人购买保险是为了在发生保险事故时能够获得合理的经济补偿，以恢复到事故发生前的经济状况。如果保险公司以不合理的理由对赔付金额打折，就破坏了这种公平性，损害了投保人的合法权益。

保险公司与4S店之间的合作关系是它们两者之间的商业安排，与投保人应获得的赔付金额没有直接关系。不能将这种合作关系带来的成本或其他因素转嫁到投保人身上，让投保人承担不合理的损失。

从监管规定角度

保险行业受到严格的监管，保险公司的经营行为必须遵守相关的法律法规和监管规定。监管部门要求保险公司在理赔时要做到及时、准确、合理，保障投保人的合法权益。如果保险公司随意对赔付金额打折，可能违反了监管规定，会面临监管部门的处罚。

建议：

1. 仔细审查保险合同：查看合同中关于车辆全损赔付的条款，确定保险公司应赔付的金额计算方式，看其打折行为是否有合同依据。
2. 与保险公司沟通协商：向保险公司明确指出其打折行为的不合理性，要求其按照合同约定和法律规定进行全额赔付。可以要求保险公司提供打折的具体依据和理由。
3. 寻求监管部门帮助：如果与保险公司协商无果，可以向当地的保险监管部门投诉，反映保险公司的不合理行为，让监管部门介入调查和处理。
4. 考虑法律途径：必要时，你可以通过向法院提起诉讼的方式来维护自己的合法权益，要求保险公司按照约定进行赔付。

如果你在处理这个问题过程中还有其他疑问或需要进一步的帮助，可以直接向我咨询。