结论前置：公司入职查乙肝是否违法，需根据具体情况分析。一般情况下，未经员工同意进行乙肝检查可能侵犯隐私权，构成违法；但在特定行业如食品、药品、幼教等，因涉及公共卫生安全，相关法规可能要求乙肝检查，此时需确保检查合法、公正且结果保密。

详细分析：

1. 一般情况下的乙肝检查规定：

   • 根据相关法律法规，用人单位在招、用工过程中，除国家法律、行政法规和卫生部规定禁止从事的工作外，不得强行将乙肝病毒血清学指标作为体检标准。这意味着，在普通入职体检或职业健康检查中，公司未经员工同意擅自检查乙肝相关项目是违法的，可能侵犯员工的隐私权等相关权利。
   • 举例：如果一家普通公司要求所有新入职员工进行乙肝检查，且未事先征得员工同意，那么这种行为就可能构成违法，员工有权拒绝并可以向相关部门投诉。

2. 特殊职业情况下的乙肝检查规定：

   • 对于某些特定职业，如食品生产经营、饮用水生产供应、公共场所服务、托幼机构保育等，由于这些职业直接涉及公共卫生安全，相关法律法规可能要求员工进行乙肝项目检测。在这些特定职业的入职体检中，公司要求检查乙肝项目是符合规定的。
   • 举例：一家幼儿园在招聘保育员时，要求应聘者进行乙肝检查，这是符合规定的，因为保育员的工作直接涉及儿童的健康和安全。但即便如此，幼儿园也需确保检查过程的合法性、公正性，并严格保密检查结果。

3. 公司应遵守的法律原则：

   • 无论在哪种情况下，公司在进行乙肝检查时都应充分尊重员工的权益，确保检查行为的合规性。如需进行乙肝检查，公司应事先征得员工的明确同意，并告知检查的目的、范围以及结果的保密措施。
   • 建议：公司可以制定明确的入职体检政策，明确哪些情况下需要进行乙肝检查，并确保这些政策符合相关法律法规的要求。同时，公司还应建立健全的隐私保护机制，确保员工的个人信息不被泄露或滥用。

总结与进一步行动建议：

• 对于员工而言，如果公司未经同意要求进行乙肝检查，可以拒绝并了解相关法律法规以维护自己的权益。
• 对于公司而言，应严格遵守相关法律法规，避免擅自进行乙肝检查。如果确实需要进行乙肝检查（如特定职业要求），应确保检查过程的合法、公正与保密。

如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供详细的法律建议。