结论前置：

1. 一年合同约定三个月试用期，在大多数情况下是不合法的。根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，一年期劳动合同的试用期最长不得超过二个月。
2. 若违法约定试用期并已履行，用人单位需承担法律责任，包括支付赔偿金等。

详细分析：

一、法律依据

根据《中华人民共和国劳动合同法》第十九条的规定，劳动合同期限与试用期的时长存在严格的对应关系。具体来说：

• 劳动合同期限三个月以上不满一年的，试用期不得超过一个月；
• 劳动合同期限一年以上不满三年的，试用期不得超过二个月；
• 三年以上固定期限和无固定期限的劳动合同，试用期不得超过六个月。

在上述规定中，“以上”包含本数，“不满”不包含本数。因此，对于一年期的劳动合同，试用期应严格控制在二个月以内。若约定为三个月，则明显超出了法律规定的二个月上限，这一部分是不合法的。

二、超期试用的后果

如果用人单位与劳动者签订了一年期劳动合同并错误地约定了三个月试用期，且该试用期已经履行完毕，那么用人单位将面临法律责任。根据《中华人民共和国劳动合同法》第八十三条的规定，用人单位需承担以下责任：

• 由劳动行政部门责令改正；
• 若违法约定的试用期已经履行，用人单位需以劳动者试用期满月工资为标准，按已履行的超过法定试用期的期间向劳动者支付赔偿金。

举例说明：

假设小张与某单位签订了一年期劳动合同，约定试用期三个月，且试用期工资为5000元/月，转正后工资为6000元/月。若该试用期已履行完毕，则单位除正常支付试用期工资外，还需额外支付小张一个月转正后的工资6000元作为赔偿金。

三、劳动者的应对措施

面对不合法的试用期约定，劳动者有权采取以下措施保护自己的权益：

1. 与用人单位协商：首先尝试与用人单位沟通，要求将试用期调整为符合法律规定的期限。
2. 向劳动监察部门投诉：如果协商无果，劳动者可以向当地的劳动监察部门投诉，请求其介入调查并责令用人单位改正。
3. 申请劳动仲裁：作为更进一步的措施，劳动者还可以向劳动仲裁委员会申请仲裁，要求用人单位承担法律责任，包括改正错误并支付可能的赔偿金。

四、特殊情况下的考虑

尽管法律对试用期有明确规定，但在某些特殊情况下（如双方平等自愿、协商一致且不违反法律强制性规定等），试用期约定可能具有一定的灵活性。然而，这种情况较为罕见，且通常不建议依赖此类例外情况来规避法律限制。因此，在大多数情况下，一年合同约定三个月试用期仍然是不合法的。

总结与建议：

综上所述，一年合同约定三个月试用期在大多数情况下是不合法的。劳动者在遇到此类情况时，应及时了解自己的权益，并通过合法途径来维护自己的利益。同时，用人单位也应严格遵守法律法规，合理设定试用期，以构建和谐的劳动关系。如果你有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。